Из ветхозаветных апокрифов приводятся молитва Манассии (глава 7) и история Сусанны (глава 11). В главе 26(27) пророк Малахия называется ангелом. В «Дидаскалии апостолов» цитируются почти все книги Нового Завета, за исключением Откровения Иоанна Богослова. Важной для новозаветной текстологии является цитата из перикопы о взятой в прелюбодеянии (Ин. 7:53–8:11), которая приводится в конце главе 7. Кроме того, в главе 21 встречается аграфа, основанная на Мф. 5:44 и Лк. 6:27, – «молитесь за врагов ваших». В «Дидаскалии апостолов» встречается отличающаяся от канонической хронология Страстей Христовых: Тайная вечеря – во вторник, взятие под стражу – в среду, допрос у Пилата – в четверг, Распятие – в пятницу (глава 21). Однозначного объяснения этому факту пока не найдено. Вероятно, автор «Дидаскалии апостолов» использовал иную календарную систему или следовал известному только в его общине преданию. Кроме того, в «Дидаскалии апостолов» есть и другие отличия от повествований канонических Евангелий: приводится предание о том, как Матерь Божья приходила вместе с Марией Магдалиной ко Гробу; апостол Пётр и Кифа фигурируют как два разных лица. В той же главе 21 несколько раз цитируется апокрифическое «Евангелие Петра». Автор «Дидаскалии апостолов» знал «Дидахе» (вероятно, это древнейшее свидетельство о памятнике) и послание апостола Варнавы. В «Дидаскалии апостолов» церковь называется кафолической (глава 9) и единой (глава 23). Большое внимание уделяется церковной иерархии, однако перечисление степеней клира в разных главах различается. В предисловии, предваряющем главу 1, упоминаются следующие священнослужители и церковнослужители: епископ (который ещё называется пастырем), пресвитеры (или учители), диаконы (или служители), иподиаконы (или помощники), чтецы и певцы. В главах 3. 6 к клиру относятся: епископ, пресвитер, диакон, чтец, вдовица. Кроме того, в «Дидаскалии апостолов» несколько раз упоминаются диакониссы. В связи с этим некоторые исследователи полагают, что упоминания о чинах иподиаконов и диаконисс могут быть интерполяциями (но, например, Артур Выыбус признаёт аутентичность этих мест). В главах 3. 3. 5 и 9 проводятся нехарактерные для христианской литературы I–II вв. прямые параллели между клириками и служителями ветхозаветного храма: епископ сравнивается с первосвященником, пресвитеры – со священниками, диаконы – с левитами. Согласно «Дидаскалии апостолов», епископ представляет в общине Бога Всемогущего, он – уста Божьи, без него ничего не делается в церкви. Он толкует Священное Писание и может излагать истины христианской веры. Епископ избирается всем народом по воле Святого Духа. Обязательными для хиротонии являются высокие нравственные качества кандидатов, знание ими чинопоследований и канонов церкви. Лучше, если кандидат не имеет жены. Хиротония совершается в воскресенье с участием всех пресвитеров и епископов из соседних епархий. Он не должен быть моложе 50 лет (исключение делается для небольших общин). Пресвитеры выполняют, в основном, совещательные функции. В главе 9 они сравниваются с апостолами (поэтому их должно быть 12) и могут иметь дары исцелений. Кроме того, они проповедуют, учат и молятся.