К 1720 г. рядом с храмом стояли каменные святые врата и часовня, предназначенная для исполнения треб проезжавших по дороге. В часовне находился старинный иконостас. В апреле 1742 г. в Малицкой слободе проездом из Санкт-Петербурга в Москву остановилась беременная графиня Мавра Егоровна Шувалова (ум. в 1759 г.), статс-дама императрицы Елизаветы Петровны. Она тяжело заболела в дороге и исцелилась после молебна перед иконой Николая Чудотворца, благополучно добралась до Москвы и родила сына, которого назвала Николаем. Вскоре М.Е. Шувалова вместе с супругом, президентом Военной коллегии графом Петром Ивановичем Шуваловым, стала благотворительницей обители. 1 марта 1743 г. на средства Шуваловых на заводе Демидова в Невьянске был отлит колокол весом 126 пудов 27 фунтов. С 1751 г. по обету и на средства графа П.И. Шувалова (ум. в 1762 г.) на территории Малицкого монастыря началось возведение каменных построек, в результате сложился единый архитектурный ансамбль в стиле барокко. В центре, на месте разобранного Спасского храма (1676 г.), был возведён в 1754 г. одноглавый двусветный трёхпрестольный Спасский собор с трапезной (с западной стороны), правым приделом Николая Чудотворца, левым – святых праведных Захарии и Елисаветы (впоследствии помещение ризницы). По описи 1910 г., собор был 30 аршин в длину, 30 аршин в ширину, 22 аршина в высоту (Государственный архив Тверской области). Строила храм артель Фомы Павлова, крестьянина монастырской слободы Селижаровского Троицкого монастыря. Внутри стены были полностью расписаны в 1861–1862 гг., новый иконостас помещён в 1862 г. В Никольском приделе был устроен склеп, в котором похоронили графиню М.Е. Шувалову (ум. в 1759 г.). Над святыми вратами Малицкого монастыря была возведена трёхъярусная колокольня. В июле 1891 г. в обитель был доставлен отлитый на московском заводе Самгина колокол, весивший 293 пуда 20 фунтов. На колокольне стало шесть колоколов, в том числе самый древний, отлитый при игумене Иоиле в 1687 г. весом 14 пудов; колокол весом 126 пудов 27 фунтов, отлитый в 1743 г. и пожертвованный Шуваловыми; колокол весом 52 пуда, отлитый в 1840 г. строителем Иоасафом; и последний – самый большой колокол, отлитый при архимандрите Данииле (Чижове). В XVIII в. по сторонам от колокольни симметрично располагались одноглавые церкви: на востоке – в честь Покрова Пресвятой Богородицы (тёплая) с часовней; на западе – во имя преподобного Петра Афонского (не была достроена). На южной стороне ограды была построена церковь, которую предполагалось освятить во имя мучеников Тимофея и Мавры, но в 1771 г. она была перестроена в настоятельский корпус. Кроме зимних и летних комнат в настоятельском корпусе имелось ещё шесть келий. В XVIII в. одновременно с возведением Спасского собора велось строительство братских келий на восточной стороне монастыря. Первоначально у каждой кельи был отдельный свод, но после ремонта 1829 г. своды заменили накладным потолком. Сохранился проектный чертёж братского корпуса 1829 г., подписанный губернским архитектором Иваном Фёдоровичем Львовым и Тверским и Кашинским архиепископом Амвросием (Протасовым), но при строительстве и перестройках в него были внесены изменения.