В 583 г., после крупного нападения и разграбления крепостей Сингидун (ныне Белград, Сербия), Анхиал (ныне Поморие, Болгария), Виминакий (близ современного Костолаца, Сербия) и Августы (устье реки Огоста, Болгария) на Балканах, славяне впервые остались зимовать на территории империи. Византийцы, в основном, контролировали границу по Дунаю и морским побережьям, но многие внутренние районы Балкан постепенно выходили из-под их контроля, местное население покидало их, и там расселялись славянские племенные союзы. Уже в 584 г. славяне доходили до Длинной стены Константинополя; Маврикий лично организовывал оборону предместий столицы, но затем византийское войско Коменциола разбило славян под Адрианополем (ныне Эдирне, Турция). В сентябре 586 г. славяне попытались напасть на Фессалонику, осаждали город в течение восьми дней, но без успеха («Свод древнейших письменных известий о славянах. Маврикий» М., 1995 г. том 2). Весной 592 г., одержав победу на Востоке, Маврикий решил лично возглавить поход против авар. Переправился морем из Константинополя в Ираклию Фракийскую, но 19 марта произошло солнечное затмение, а затем ещё несколько незначительных событий, которые были истолкованы как неблагоприятные знамения, и поход был отменён. Фактические военные действия против авар возглавил Приск, который в 593 г. вытеснил основные силы авар и славян за Дунай, но отказался выполнить приказ Маврикия перейти на северный берег Дуная из-за недовольства в армии. С 594 г. войска возглавил брат Маврикия Пётр, но он не смог отразить новое масштабное нападение варваров. Переправив армию на северный берег Дуная, он разгромил ставку одного из славянских князей, Пирагаста, но затем потерпел поражение в битве с крупными силами славян и был вынужден отступать через Дунай на юг. Армию вновь возглавил Приск, он возобновил военные действия за Дунаем, но успехов не достиг. В 597 г. авары и славяне одновременно напали на Сингидун и Томы (ныне Констанца, Румыния), византийцы не сдержали их натиск и отступили от Дуная вглубь Балканского полуострова. В Константинополе при известии о поражениях началась паника, население бежало в Азию, но наступление варваров вскоре остановилось из-за эпидемии чумы в их лагере. Маврикий направил посольство к аварам и заключил с ними мир при условии ухода авар с имперских земель и выплаты им византийским правительством 120 тыс. номисм. При этом Маврикий отказался выкупать пленников, и авары их убили. Позднее Маврикий рассылал дары во все восточные патриархаты для поминовения погибших пленных ромеев. Но вскоре Маврикий объявил о разрыве с аварами и отправил главные силы византийской армии во главе с Приском на Дунай. Летом 600 г. византийцы перешли на северный берег у Виминакия, разгромили авар, славян и гепидов и оттеснили варваров за реку Тиса, навязав им мирный договор на более выгодных условиях. С конца 601 г. армию вновь возглавил Пётр, который успешно отразил очередное нападение авар на Балканы. Осенью 602 г. армия получила приказ Маврикия об устройстве зимних лагерей на северном берегу Дуная, что вызвало всеобщий мятеж и привело к свержению Маврикия. На Западе с правлением Маврикия связано формирование византийских экзархатов: Равеннского в Италии и Карфагенского в Северной Африке, особых полуавтономных областей, в которых вся власть передавалась экзархам, одновременно исполнявшим должности гражданских администраторов и военных командующих.