Семейная жизнь Генриетты не заладилась. В августе 1626 г. Карл I выслал из Англии французскую свиту жены (их обвинили в католическом заговоре), а королева оказалась фактически в заключении; круг её приближённых был сильно ограничен. Поводом для эскалации конфликта стало обращение к английскому королю жителей Ла-Рошели. Они просили добиться от Людовика XIII выполнения обещания срыть Пор-Луи, построенный по приказу французского монарха в 1622 г. в 2 км от Ла-Рошели (с целью присматривать за городом). В начале 1627 г. Карл I приказал английским кораблям перехватывать все французские суда в открытом море. 27 июня пять английских эскадр из 98 кораблей под командованием Джорджа Вильерса, герцога Бакингема, вышли из Портсмута и направились к острову Ре, где находился небольшой гарнизон под командованием бывшего королевского фаворита Жана де Кайлара де Туара. 20 июля англичане высадились на остров Ре и через два дня начали осаду крепости Сен-Мартен. Солдаты де Туара, несмотря на малочисленность и нехватку продовольствия, несколько месяцев удерживали позиции. 10 сентября 1627 г. королевская армия осадила Ла-Рошель (в городе тогда проживало 27 тыс. жителей). В ночь на 8 октября 1627 г. король направил небольшое подкрепление окружённому англичанами де Туару (из 35 лодок прорвались 25). 6 ноября англичане, тоже получившие подкрепление, предприняли очередную попытку штурма Сен-Мартена, но атака была отбита. Людовик XIII укрепил гарнизон крепости, отправив туда отряд маршала Анри де Шомберга. Англичане, понеся большие потери (из 7 тыс. солдат у герцога Бакингема осталось только 3 тыс.), вновь были отброшены, герцог вернулся в Англию. Поскольку в Ла-Рошели продолжали получать продовольствие, было решено блокировать подступы к городу не только на суше, но и на море. С ноября 1627 г. по март 1628 г. по плану архитектора Жана-Клемана Метезо и под наблюдением архитектора Жана Тироля была возведена плотина, закрывавшая с моря вход в город. 11–19 мая англичане попытались прорвать осаду, но их остановили пушки королевской армии. 20 мая английская эскадра ушла, так и не доставив провиант в осаждённый город. В Ла-Рошели начался голод, но на предложение о сдаче гугеноты не соглашались, надеясь на прибытие английской эскадры под командованием герцога Бакингема. Но 23 августа 1628 г. в Портсмуте, готовясь к отплытию, он был убит фанатиком-пуританином Джоном Фелтоном, что задержало отправку эскадры ещё на месяц. В октябре англичанам вновь не удалось подойти к городу; жители Ла-Рошели (к тому моменту их число сократилось до 6 тыс.) были вынуждены вступить в переговоры с королём. Людовик XIII даровал прощение всем, кроме руководившего обороной города мэра Жана Гитона (он отправился в изгнание в Лондон), упразднил все привилегии города, в частности, право выбора мэра и эшевенов, и приказал срыть в Ла-Рошели крепостные сооружения (с этим не был согласен кардинал Ришелье, считавший, что укрепления необходимы Франции в противостоянии внешнему врагу). 1 ноября 1628 г., в день Всех святых, состоялся торжественный въезд короля в Ла-Рошель. Людовик XIII распорядился как можно быстрее восстановить католическое богослужение в городе. В январе 1629 г. Людовик XIII командовал «молниеносной кампанией» в Пьемонте, благодаря которой Шарль де Невер, представитель французской ветви рода Гонзага, наследовавший бездетному герцогу Винченцо II Гонзаге, стал герцогом Мантуи (этому пытались помешать Габсбурги). Затем король направился в Лангедок, чтобы уничтожить последний очаг сопротивления протестантов (апрель-июнь 1629 г.).