В 1883 г. в деревне Шуклинка, в семи верстах от Курска, на земле, пожертвованной купцом Д. Созоновым, был устроен Александро-Невский скит. 26 августа 1891 г. в скиту Курским епископом Иустином (Охотиным) была освящена каменная церковь во имя св. Александра Невского и равноапостольной Марии Магдалины с колокольней (в память избавления императора Александра III и его семьи от грозившей им опасности при крушении поезда 17 октября 1888 г. на станции Борки). В качестве благодетелей церкви-памятника выступили курские дворяне, собравшие деньги на покупку напрестольного убранства, а также инокиня Лидия, пожертвовавшая 3 тыс. руб. на постройку храма. Свой вклад внесли и курские учебные заведения. На освящении присутствовали директор мужской гимназии Даниил Григорьевич Жаворонков (1821–1901 гг.; почётный гражданин города Курска, похоронен в ограде монастыря), генерал Николай Иванович Чагин и др. 25 сентября 1903 г. был освящён скитский тёплый храм во имя Николая Чудотворца. 28 сентября 1898 г. освящена скитская монашеская богадельня на десять престарелых насельниц. В 1909 г. в скиту был устроен колодец. 14 февраля 1869 г. в Курском женском монастыре была открыта двухклассная (старшее и младшее отделения) школа для девочек, в 1888 г. преобразованная в церковноприходскую одноклассную с тремя (позже с четырьмя) отделениями. Школа считалась приготовительным учебным заведением для поступления в старшие классы епархиального женского училища или в Мариинскую женскую гимназию. Обучение было бесплатное и сначала сословное (для девиц духовного звания, в том числе сирот, заботу о которых полностью брал на себя монастырь), позже стали принимать детей всех сословий. Забота о воспитанницах, а также содержание в чистоте и порядке помещения поручались сёстрам обители. Преподавание велось монастырским священником и теми насельницами, которые получили образование до поступления в монастырь. Преподавали Закон Божий, русскую грамматику, арифметику, географию, рукоделие. В 1874 г., при игуменьи Софии, монастырскую школу посетил архиепископ Литовский и Виленский Макарий (Булгаков). Игуменья София была попечительницей двух приютов для детей-сирот (для мальчиков и девочек), помогала пожертвованиями Курской духовной семинарии, была действительным членом Курского миссионерско-просветительского братства, Курского отдела Императорского православного палестинского общества, принимала активное участие в работе Императорского Археологического общества. Во время Русско-турецкой войны 1877–1878 гг. игуменья София взяла под монастырскую опеку Курский лазарет и оказывала помощь раненым воинам продуктами, деньгами, бельём. Под её опытным руководством в лазарете трудились усердные сиделки. В 1883 г. 12 сестёр, в том числе и игуменья София, были награждены почётным знаком «Красного Креста». В течение 29 лет игуменья была начальницей женского епархиального училища и ежегодно жертвовала свой годовой оклад (500 руб.) в его пользу. Из воспитанниц сформировался один из лучших хоров города. Училищная библиотека была образцовой. Для ознакомления с учебным процессом женское училище посещали обер-прокуроры Синода.