Председатель комиссии считал необходимым принять в срочном порядке самые серьёзные меры для исправления «катастрофического положения, сложившегося в религиозном вопросе». Для этого предлагалось устранить административное давление местных властей на верующих и религиозные организации, обновить законодательство о культах, выработать и принять общесоюзный закон о свободе совести и обеспечить его единообразное применение на всей территории страны. В мае того же года по представлению Комиссии по вопросам культов Президиум ВЦИК направил в местные органы власти циркуляр с требованием «прекратить административные меры борьбы с религиозными пережитками трудящихся масс» и с предупреждением о строгой ответственности за нарушение постановления ВЦИК и СНК РСФСР «О религиозных объединениях» от 8 апреля 1929 г.: «Виновные, невзирая на лица, будут привлекаться к строгой ответственности». Тогда же состоялось показательное заседание комиссии, на котором разбиралась деятельность органов власти Воронежской области, откуда поступало наибольшее число жалоб на нарушения законодательства о культах. Выступивший на заседании секретарь Совета национальностей ЦИК СССР Александр Исакович Хацкевич (представитель Белоруссии) отметил, что закрытие церквей «методами разных махинаций» ведёт к тому, что «религиозность загоняется в подполье», и предложил признать работу Воронежского облисполкома неудовлетворительной. В октябре 1936 г. П.А. Красиков сообщил прокурору СССР Андрею Януарьевичу Вышинскому о повсеместном самоуправстве местных властей в отношении духовенства и верующих. Он привёл факты ликвидации религиозных общин, закрытия молитвенных зданий без соответствующих решений ЦИК СССР и ВЦИК, изъятия храмов под хозяйственные нужды, запрета проводить богослужения и др. П.А. Красиков просил пресекать подобные действия местных властей, однако прокуратура отвергла его утверждение о повсеместном нарушении законодательства о культах. В ноябре 1936 г. Комиссия по вопросам культов приступила к работе над проектом союзного закона о культах. Вопрос о религиозном законодательстве рассматривался на совещании с участием представителей АН СССР, Центрального совета Союза воинствующих безбожников, некоторых центральных ведомств. Были оглашены данные комиссии о количестве молитвенных зданий. На тот момент в СССР насчитывалось 42,4 тыс. культовых зданий, из которых состояли на регистрации 30,8 тыс. зданий. Но и из них действующими были 20,9 тыс. зданий, а ещё 9,9 тыс. хотя и числились зарегистрированными, но были изъяты у верующих в административном порядке (как правило, под хозяйственные нужды – засыпку зерна и т.п.). На совещании было отмечено резкое сокращение числа культовых зданий в СССР по сравнению с дореволюционным периодом. Так, в РСФСР осталось 35% молитвенных зданий, на Украине – 9, в Белоруссии – 11, в Узбекистане – 31, в Армении – 6, в Азербайджане – 4%. Всего в СССР на тот период оставалось 28% от того количества молитвенных зданий, которое было в дореволюционной России.