Одним из главных источников поступления средств стал открытый в 1765 г. у стен монастыря минеральный источник, на основе которого в середине XIX в. была устроена лечебница с холодными и тёплыми ваннами. Во второй половине XIX в. в обители находилась церковноприходская школа на 30 мальчиков и девочек, богадельня на четыре человека. К середине XIX в. Корнилиев Комельский монастырь получал постоянные денежные средства от государства – 466 руб. 62 коп., а также до 300 руб. в качестве процентов по ценным бумагам. Кроме того, содержание Корнилиева Комельского монастыря обеспечивали доходы с мельниц, от рыбных ловель, а также средства, вырученные от продажи свечей и проч. В начале ХХ в. Корнилиев Комельский монастырь владел около 170 десятинами земли, на которой располагались строения, коммуникации и сенокосы. В 1908–1911 гг. капитал Корнилиева Комельского монастыря составляли 47 986 руб. Вскоре после революции 1917 г., следуя декрету «Об отделении церкви от государства и школы от церкви», власти Грязовецкого уезда, на территории которого находился монастырь, начали по своему усмотрению распоряжаться монастырским имуществом. В обители был размещён детский дом «Республиканец». 25–26 марта 1924 г. решением президиума Грязовецкого уисполкома закрывались все монастыри района. Согласно докладной записке председателя Грязовецкого уисполкома П.Е. Едемского Президиуму ВЦИК, хозяйственное состояние Корнилиева Комельского монастыря к этому времени было скудным, «монашествующие и совет это признали как явление бесспорное и с закрытием [монастыря] целиком согласились». 15 апреля 1924 г. Корнилиев Комельский монастырь был официально закрыт, а насельники – «старики… помещены в доме призреваемых». Но корнилиевские монахи в отличие, например, от насельников соседнего Павлова Обнорского монастыря закрытию обители не сопротивлялись: «...Верующие, совет и монахи сказали открыто, что давно пора [закрыть], и никаких ходатайств». В одной из монастырских церквей предполагалось создать «народный дом», вторую церковь – отдать под квартиры, а третью – разобрать «ввиду разрушенности её». Братский корпус следовало передать «губсоцстраху для использования под дом отдыха рабочим и служащим». В 1920 гг. на территории Корнилиева Комельского монастыря был устроен санаторий Архангельского союза леса и сплава; с 1939 г. в бывших монастырских зданиях размещали интернированных польских военных. 28 декабря 1941 г. НКВД СССР выпустил приказ «Об организации специальных лагерей для бывших военнослужащих Красной армии, находившихся в плену и окружении противника». Одним из таких лагерей стал расположившийся в бывшем монастыре Грязовецкий спецлагерь №150. Поступавшие в лагерь с конца января 1942 г. военнослужащие размещались в «двухэтажном кирпичном корпусе» (вероятно, здание трапезной палаты), четырёх деревянных бараках и брезентовых палатках. Всего за период существования Грязовецкого спецлагеря через его бараки прошли 12 687 военнослужащих РККА. С марта 1943 г. в Грязовецком спецлагере содержали немецких военнопленных. После 1945 г. на территории монастыря находилась тюрьма, где отбывали срок осуждённые по 58-й статье УК СССР. В 1950 гг. была открыта областная психиатрическая больница, просуществовавшая до 1990 гг. К 2015 г. здания Корнилиева Комельского монастыря находились в руинах. Сохранились развалины трапезной палаты с Воскресенской церковью и фрагменты пристроенных к ней в XIX в. зданий.