Главная святыня Корельского монастыря – мощи святых Антония и Феликса, пребывавшие под спудом. Первоначально над захоронением был построен деревянный Никольский храм, после возведения каменного собора – деревянная Сретенская церковь, в 1860 г. – каменная Сретенская часовня. После сноса часовни и проведения земляных работ на бывшей монастырской территории место погребения святых оказалось утеряно. 13 ноября 2012 г. старший научный сотрудник Института земного магнетизма РАН профессор П.А. Морозов проводил исследования грунта георадарным бесконтактным методом на бывшей территории обители, в том числе на предполагаемом месте Сретенской часовни. Были выявлены предположительно остатки фундамента, в центре которого на глубине 4–4,5 м обнаружено сооружение из древесины твёрдых пород, напоминающее домовину. 6 декабря 2012 г. по благословению митрополита Архангельского и Холмогорского Даниила (Доровских) на месте предполагаемого захоронения был установлен крест. В 1920 г. на основании Декрета Совнаркома от 20 января 1918 г. об отделении церкви от государства Корельский монастырь был национализирован. К этому времени в обители проживали иеромонах Нектарий, иеродиакон Никон и несколько трудников, которые следили за хозяйством, спасая от грабежа и погрома постройки и имущество. 2 и 3 сентября 1920 г. в Корельском монастыре работала первая научная экспедиция, организованная Российской академией истории материальной культуры и Отделом Наркомпроса по делам музеев и охране памятников искусства и старины для обследования историко-художественных ценностей Северного края. Экспедицией руководил Игорь Эммануилович Грабарь, заместитель заведующего отделом Наркомпроса по делам музеев. Сохранились материалы экспедиции и подлинники фотографий (Отдел рукописей Третьяковской галереи). И.Э. Грабарь писал, что Корельский монастырь «обещал богатую жатву, которую мы и нашли… Только эти два храма в Николо-Корельском монастыре и три деревянные церкви в Нёноксе заключают достаточный материал, чтобы превратить Архангельский музей… в первоклассный музей древнерусского искусства». В журнале экспедиции отмечалось: «Многие из икон относятся к XV и даже XIV веку и представляют выдающийся интерес» (Отдел рукописей Третьяковской галереи). 28 ноября 1920 г. Архангельский губисполком принял решение «об использовании помещений бывшего Николо-Корельского монастыря для колонии дефективных детей», рассчитанной на проживание 100 человек (Государственный архив Архангельской области). Губернский карательный отряд, настаивая на предоставлении именно этой территории под детскую колонию, считал, что здесь, вдали от населённых пунктов (город находился в 35 верстах, деревня – в 12), юные преступники перевоспитаются быстрее. 23 декабря того же года члены комиссии карательного отдела, ведающего содержанием тюрем и колоний на территории Архангельской губернии, в присутствии завхоза колонии иеромонаха Нектария и иеродиакона Никона описали имущество и приняли хозяйство колонии. В январе 1921 г. межведомственной комиссией была проведена повторная проверка Корельского монастыря со всем движимым и недвижимым имуществом. Комиссия постановила: «Принятое и перечисленное в описях разное имущество и инвентарь передать Губкаратотделу на хранение под расписку завхоза колонии т. Григорьева и пустить его в расход, за исключением церковной утвари и принадлежностей, для нужд устраиваемой Губкаратом в монастыре колонии».