В описи 1551 г. указано, что в собрании Корельского монастыря хранились Евангелие-тетр «в десть, на бумазе, без Еуангелистов», Апостол-тетр «на бумазе, заставицы на золоте», две Псалтири, «Шестодневец», Минеи, Ирмологий «под знаменьем», Триоди Постная и Цветная, Служебники, а также характерные для монашеской среды «Лествица Толковая в полдесть», сочинения преподобных Дорофея Газского, Симеона Нового Богослова и Петра Дамаскина. Сведения о вкладах в Корельский монастырь отдельных рукописей исследователи встречают в приходо-расходных книгах. Так, в 1565 г. дьяк Василий подарил «Часословец», в 1572 г. архангельский диакон Сергий привёз из Москвы Евангелие-тетр. За этот подарок родители вкладчика были записаны в монастырский синодик для поминания. А Иван Михайлов Чуркин, посетивший обитель, пожертвовал «то Евангелие поволок бархатом на золоте, да евангелисты приложил серебряныя позолочены сусальным золотом, да дал тот же Иван книгу Лествица в десять». Самые ранние сведения о покупке монастырём книг относятся, по мнению исследователей, к 1552 г.: приобретено две книги (по 3 руб.) – «Лествица в полдесять и Ефрем Сирин в десять». В 1553 г. для библиотеки был куплен «Часословец», переплетённый «в затылок». С середины XVI в. исследователям известно и о написании книг за плату. Так, в 1558 г., при игумене Трифоне, были переписаны шесть рукописей, две из них – Леонтием Вощечниковым. Среди писцов были и монастырские насельники, и приходящие. Старец Акакий жил в Корельском монастыре, пока писал Апостол и обучал письму старца Варлаама. В течение десяти месяцев пребывал в Корельском монастыре некий Дружина, написавший 34 тетради Киево-Печерского патерика. В описи 1601 г. упоминаются хранившиеся при Никольской церкви: Евангелие-тетр «в полдесть», украшенное «бархатом золотным»; Евангелие-тетр «в десть, поволочено зенденью»; Евангелие-апракос «в полдесть, украшенное синим бархатом»; толковое Евангелие, несколько книг Апостол, два Октоиха, три Ирмология, Псалтири, несколько Служебников и Часословов, три Пролога, Минея общая «в тетрадех, в полдесть, недописана», «Правило большое апостольское и седми Соборов святых отец», «Лествица с толкованием», «Патерик скитской», «Сборник постный от мытаря и фарисея до велика дни», «Сборник от велика дни до Всех святых», Киево-Печерский патерик, сборник с Житиями святых Варлаама Хутынского и Климента, папы Римского, сборник с Житиями Николая Чудотворца и Сергия Радонежского, Житие Александра Свирского «в тетрадех», книги «Приточник Соломонов», «Ивана Богослова книжка от Бытии и от Пчелы, в четверть», сочинения Дионисия Ареопагита, Василия Великого, преподобных Симеона Нового Богослова, Ефрема Сирина, Петра Дамаскина и др. К концу XVII в. книжное собрание Корельского монастыря, насчитывавшее 289 книг, располагалось в тёплой каменной Успенской церкви, «над келарскою вверху». В 1895 г. в рамках работы Архангельского епархиального церковно-археологического комитета была составлена опись монастырской библиотеки. Над разбором архива трудилась комиссия, в состав которой входили Иустин Михайлович Сибирцев, Степан Фёдорович Огородников и др. Рукописное собрание поступило в архив Историко-археографической комиссии, а в 1931 г. (в составе Архангельского собрания) – в Рукописный отдел Библиотеки Академии Наук. В фондах отдела выявлены 22 рукописи, ранее принадлежавшие монастырю; 18 из них ещё в период описания в Архангельске выделены как отдельное собрание Корельского монастыря, а три отнесены к фонду «Древлехранилище», хотя отмечены в описании И.М. Сибирцева как «Синодики Николо-Корельского монастыря». Из 22 рукописей одна относится к XVI в., две – к XIX в., остальные – к XVII–XVIII вв. Сохранились «Деяния святых апостолов» и Соборные послания, Канонник, Выписки из книг Ветхого и Нового Заветов, службы и Жития святых, сборник поучительных и богослужебных статей, канон Успению Пресвятой Богородицы, служба «Пресвятой Богородице Толгской» и другие рукописи. Монастырские документы хранятся также в Российском государственном архиве древних актов.