К концу 1920 гг. вполне сформировался круг последователей Кирилла, к которому могут быть отнесены такие епископы, как Дамаскин (Цедрик), Афанасий (Сахаров), Василий (Преображенский), Иоасаф (Удалов), Амфилохий (Скворцов). Близкими по своей церковной позиции к Кириллу были также архиепископ Серафим (Самойлович), Прокопий (Титов), Пахомий (Кедров), епископ Серафим (Звездинский), Парфений (Брянских) и другие из числа «непоминающих» (т.е. не поминавших при богослужении заместителя патриаршего местоблюстителя митрополита Сергия). Кирилл с большим уважением относился к архимандриту Неофиту (Осипову), которого именовал в письмах не иначе как «Авва». Патриарший местоблюститель митрополит Пётр, находившийся в ссылке в приполярном посёлке Хэ Обдорского района Тобольского округа, благодаря усилиям епископа Дамаскина (Цедрика) узнал о разразившихся в церкви спорах по поводу деятельности митрополита Сергия. Среди прочих церковных документов конца 1920 гг. посыльными епископа Дамаскина митрополиту Петру были переданы и письма Кирилла. Своё отношение к политике заместителя местоблюститель митрополит Пётр выразил в письме митрополиту Сергию в декабре 1929 г., охарактеризовав её как ошибку, поставившую церковь в унизительное положение, вызвавшую в ней раздоры и разделения и омрачившую репутацию её предстоятелей. Не обошёл стороной митрополит Пётр и вопрос о полномочиях митрополита Сергия: «Смею заявить, что званием заместителя Вам предоставлены полномочия только для распоряжения текущими делами, быть только охранителем существующего порядка… Каких-либо учредительных прав я Вам не предоставлял, пока состою Местоблюстителем, и пока здравствует митрополит Кирилл, а в то время был жив и митрополит Агафангел… Для меня не было сомнений, что заместитель прав установленных не заменит, а лишь заместит, явит собою, так сказать, тот центральный орган, через который Местоблюститель мог бы иметь общение с паствой. Проводимая же Вами система управления не только исключает это, но и самую потребность в существовании Местоблюстителя». Патриарший местоблюститель имел практически такое же понимание объёма полномочий своего заместителя, что и Кирилл, который писал в июне 1929 г. епископу Дамаскину: «Призвание митрополита Сергия к заместительству вовсе не в том заключалось и заключается, чтобы заменить своею персоною митрополита Петра, но лишь заместить его, дать собою тот общедоступный центр, то место, через которое мысли, желания и руководственные указания митрополита Петра, как Местоблюстителя, могли бы проникать в среду церковную». Единство взглядов с Кирилла о границах власти, переданной патриаршим местоблюстителем своему заместителю, побудило митрополита Петра использовать буквально его объяснение из письма епископу Дамаскину. В декабре 1929 г. срок ссылки Кирилла истёк, но разрешение на свободный выезд он не получил. 8 февраля 1930 г. Кирилл был арестован в Енисейске, а затем помещён в красноярскую тюрьму специального назначения. 22 февраля Кириллу было предъявлено обвинение в том, что он «имел связь с контрреволюционной монархической организацией, раскрытой на Северном Кавказе».