17 декабря 1921 г. священнослужители Князь-Владимирского собора подали расписки, в которых подтвердили, что без специального разрешения не будут устраивать никаких «сборищ помимо церковных служб». В последней декаде апреля 1922 г. произошло «изъятие церковных ценностей» собора, причём значительная часть серебряных изделий (окладов икон и Евангелий) была заменена верующими по весу собранным ими столовым серебром. Сопротивления властям верующие не оказывали. Тем не менее, на судебном процессе против православного епископата, духовенства и мирян, который открылся 10 июня 1922 г., в число 86 обвиняемых во главе с митроиолитом Вениамином (Богоявленским) вошли настоятель Князь-Владимирского собора протоиерей М. Союзов (получил три года лишения свободы и умер в том же году в тюрьме) и бывший настоятель протоиерей Леонид Богоявленский (осуждён на смерть, помилован). В июле 1922 г. должность настоятеля и председателя приходского совета собора занял обновленческий «протопресвитер» В. Красницкий, не пользовавшийся популярностью в приходе. 26 февраля 1923 г. из состава приходского совета вышли 24 человека. Тем не менее, власти разрешили В. Красницкому принять всё имущество храма под личную ответственность. Материальное положение общины было крайне бедственным. Собор зимой не отапливался и от сырости и промерзания начал разрушаться. В. Красницкий в августе 1924 г. добровольно передал в райисполком «свободное от употребления церковное серебро» общим весом 1 пуд 26 фунтов (в том числе шесть дискосов и восемь потиров). Все драгоценные ризы и предметы из драгоценных металлов были утрачены, как и Берлинское Евангелие 1689 г. в окладе из позолоченного серебра с миниатюрными медальонами, на которых изображены Воскресение Христово и четыре евангелиста (по преданию, пожертвовано императрицей Елизаветой Петровной), и другие святыни. Для повседневных богослужений была приспособлена пономарка, а в главном нефе собора для служения зимой установили самодельную деревянную церковь, которую было легко обогреть. В. Красницкий с трудом собрал двадцатку, договор о передаче собора в пользование обновленцам был подписан 23 мая 1925 г. В июне 1926 г. распоряжением ВЦИКа было запрещено использовать деревянную церковь-тепляк в охраняемом памятнике зодчества. 30 октября Президиум Ленсовета постановил собор закрыть. Князь-Владимирский собор был закрыт 8 ноября 1926 г. Прихожан собора – тихоновцев с конца 1923 г. окормлял священник М. Дамаскинский, совершая церковные требы на квартирах. В апреле 1924 г. он был арестован и приговорён к двум годам заключения, которое отбывал в Соловецком лагере особого назначения (СЛОН). Там же с февраля 1923 г. находился и протоиерей Пётр Ивановский (клирик собора в 1927–1929 гг.). После принятия «Декларации» 1927 г. собор со всем имуществом передали общине верующих патриаршей церкви, которая взяла на себя обязательства провести в кратчайший срок ремонтно-реставрационные работы под наблюдением Главнауки. Богослужения начались 21 ноября 1927 г. В собор вернулся священник М. Дамаскинский, настоятелем был назначен митрофорный протоиерей Павел Виноградов. Здесь часто служили митрополит Ленинградский и Гдовский Серафим (Чичагов) и его викарии.