В университете В.О. Ключевский читал общий курс русской истории, а также специальные курсы. В 1887–1889 гг. занимал должность декана историко-филологического факультета, в 1889–1890 гг. – помощника ректора. В 1871 г. В.О. Ключевский был избран приват-доцентом Московской духовной академии. В 1872 г. стал доцентом, в 1879 г. – профессором, в 1882 г. – ординарным профессором, в 1897 г. – заслуженным профессором кафедры русской гражданской истории академии, в которой читал курс русской гражданской истории. В 1906 г. В.О. Ключевский покинул Московскую духовную академию; в том же году был избран почётным членом Московской духовной академии (утверждён в 1907 г.). В Александровском военном училище В.О. Ключевский читал лекции по политической истории, всеобщей и русской (1867–1883 гг.). Кроме того, преподавал историю на Высших женских курсах в Москве (1872–1888 гг.) и в Московском училище живописи, ваяния и зодчества (1898–1910 гг.). В 1893–1895 гг. В.О. Ключевский читал курс «Новейшая история Западной Европы в связи с историей России» великому князю Георгию Александровичу. Свидетельством признания заслуг историка является избрание его членом Общества истории и древностей российских (1872 г.; в 1893–1905 гг. В.О. Ключевский был его председателем), Московского археологического общества (1882 г.), Общества любителей российской словесности (1874 г.; с 1909 г. – почётный член), Московского литературно-художественного кружка (1910 г.). В 1889 г. В.О. Ключевский был избран членом-корреспондентом Императорской Академии Наук по разряду истории и древностей российских, в 1900 г. утверждён сверхштатным ординарным академиком, в 1908 г. – почётным членом академии по разряду изящной словесности. Отпевание В.О. Ключевского в университетской церкви мученицы Татианы совершили епископы Анастасий (Грибановский) и Трифон (Туркестанов) в сослужении 15 священников. В.О. Ключевский был похоронен на кладбище Донского монастыря (за алтарём Большого собора). В Пензе, в доме, где жил В.О. Ключевский, с 1991 г. действует Мемориальный музей (ул. Ключевского, 66). В 2008 г. в Пензе был установлен памятник В.О. Ключевскому. Президиумом Российской Академии Наук в 1993 г. была утверждена премия имени В.О. Ключевского за выдающийся вклад в развитие исторической науки. В научных, научно-образовательных и научно-просветительских заведениях России проходят конференции, посвящённые памяти В.О. Ключевского (Ключевские чтения). Первое крупное сочинение В.О. Ключевского было посвящено сказаниям иностранцев о России. Он исследовал около сорока памятников XV–XVII вв., многие из которых в это время ещё не были переведены на русский язык. В нём, а также в магистерской диссертации проявились качества В.О. Ключевского-источниковеда. Он собрал материал в максимальном объёме, его тщательно и всесторонне рассмотрел, провёл сравнительный анализ данных разножанровых источников. К источниковедческой проблематике В.О. Ключевский обращался и в более поздних работах. Ряд его сочинений, а также специальные курсы («Источниковедение», «Методология русской истории», «Источники русской истории» и др.), прочитанные в Московском университете, во многом заложили основы для развития вспомогательных исторических дисциплин в XX в.