В рост, в молении, вместе со св. Иоанном Предтечей и Иоанном Милостивым Иоанн изображён на прориси с иконы XVII в. Ростовой образ Иоанна (в архиерейской мантии) вводился в деисусный чин иконостаса, например, на иконе второй половины XVI в. из церкви Покрова Пресвятой Богородицы Кижского погоста (Музей изобразительных искусств Республики Карелия); на иконе с надписью: «ОА(г) ИВАНЪ ВЛ(д)КА» (XVI в., Третьяковская галерея). Общерусское почитание Иоанна и других Новгородских святителей привело к появлению его изображений на аналойных иконах-таблетках, например, в комплекте, созданном предположительно для собора в честь Рождества Пресвятой Богородицы в Суздале: на иконе с образом Святой Троицы на лицевой стороне и трёх Новгородских святителей, в том числе Иоанна, на обороте (вторая половина XVI в., Владимиро-Суздальский музей-заповедник). Иоанн изображён в коричневой мантии с красно-белыми источниками и в зелёной ризе, с большой окладистой бородой, с благословляющей десницей, в левой руке – свиток. Другой пример – на новгородской таблетке второй четверти XVI в. (Государственный Эрмитаж), где святитель изображён вместе с Симеоном Столпником и пророком Захарией. В конце XVI в. ростовой образ Иоанна, близкий к образам на лицевых пеленах и покровах, появился на полях икон-списков или повторений разного формата новгородской чудотворной иконы Божьей Матери «Знамение» (икона конца XVI – начала XVII вв., Новгородский областной музей-заповедник). Изображения Иоанна в различных изводах моления святых, как новгородских, так и иных земель, были распространены и позднее: на новгородской иконе «Избранные святые, с образом Святой Троицы» из села Курицка Новгородской области (первая четверть XVII в., частное собрание); на иконе Божьей Матери «Знамение», с Деисусом и избранными святыми (конец XVII – начало XVIII в., Русский музей); на иконе Божьей Матери «Знамение», с Новгородскими святыми и изображением новгородского Детинца (конец XVII – начало XVIII вв. (?) с поновлениями XIX в., происходит из новгородской церкви архангела Михаила на Торговой стороне, Новгородский областной музей-заповедник); на иконе «Избранные святые в молении перед Ростовской чудотворной Владимирской иконой Божьей Матери» (вторая половина XVII в., музей-заповедник «Ростовский кремль»); на иконе «Избранные святые» в московском окладе 1780 гг. (Сергиево-Посадский музей-заповедник); на девятичастном образе «Избранные праздники, образы Богоматери и святые» последней трети XVIII в. (Дом иконы на Спиридоновке в Москве); на образе Божьей Матери «Тихвинская», с Новгородскими святыми (первая половина XIX в., Русский музей). В композиции «Собор Новгородских чудотворцев» Иоанн представлен на иконе «Новгородские святые и чудотворные иконы» конца XVII в. (Сергиево-Посадский музей-заповедник); на аналогичном образе 1721 г. расширенного извода из собрания Успенских (Государственный Эрмитаж); на двух иконах «Новгородские чудотворцы» письма священника Георгия Алексеева – 1726 и 1728 гг. (Исторический музей, Третьяковская галерея); на иконе «Новгородские и избранные святые, с Ангелом-хранителем» первой половины XIX в. (Новгородский областной музей-заповедник); на иконе «Новгородские чудотворцы» 1855 г. (Рыбинский музей-заповедник); на эмалевом образе 1866 г. в оправе мастера К. Рябкова, принадлежавшем Филарету (Дроздову), Московскому митрополиту (Сергиево-Посадский музей-заповедник); на нескольких иконах конца XIX в. с поновлениями XX в. из церкви апостола Филиппа в Великом Новгороде.