4 марта 1900 г. в честь 100-летия со дня открытия в Уфе епархиального управления в Крестовой церкви архиерейского дома Иустин совершил литургию в сослужении всего старшего духовенства города. За литургией была провозглашена вечная память, отслужены заупокойная ектения о почивших служителях Уфимской епархии и благодарственный молебен с возглашением многолетий императору и царствующему дому, Синоду и архипастырю с паствой. После богослужений в покоях Иустина в архиерейском доме состоялось собрание всего духовенства и духовно-учебной корпорации во главе с епископом, на котором была прочитана краткая историческая записка о деятелях епархиального управления за сто лет существования Уфимской епархии. По предложению Иустина было принято решение напечатать особый синодик имён служителей епархии для частого поминовения за литургиями в церквах Уфимской епархии. Затем хором архиерейских певчих в ознаменование перехода епархиального управления из одного столетия в другое был пропет догматик «В Чермном мори». По благословению Иустина преподаватели епархиальных духовных учебных заведений Иван Егорович Златоверховников (1899 г.) и Константин Петрович Херувимов подготовили фундаментальные труды по истории Уфимской епархии. Работа К.П. Херувимова «К 100-летию епископской кафедры и консисториального управления в Уфе епархий, Оренбургской и Уфимской (с 4 марта 1800 г. по 21 марта 1859 г.), Уфимской и Мензелинской (с 21 марта 1859 г. по 4 марта 1900 г.)». По благословению Иустина отдельным изданием вышел один из разделов этого труда. «Наиболее же, – писал историк К.П. Херувимов, – преосвященнейший содействует успеху духовного просвещения в епархии своими многочисленными сочинениями научно-богословского и религиозно-назидательного содержания». Имелись в виду как написанные им ранее труды, составлявшие к 1900 г. 14 томов и частично изданные в период пребывания епископа на Уфимской кафедре, так и новые, созданные на Уфимской кафедре. В 1898 г. в Санкт-Петербурге вышла книга «Зерцало православного исповедания святителя Димитрия Ростовского (в русском переводе)», а в 1899 г. в Уфимской губернской типографии отпечатан «Алфавит духовный святителя Димитрия Ростовского в русском переводе епископа Уфимского Иустина». В том же году в Москве была издана книга Иустина «Жизнь во Христе». В 1901 г. в Санкт-Петербурге вышла книга «Что такое жизнь и как должно жить», подготовка которой, по мнению исследователей, была начата ещё в Уфе. Большое духовно-нравственное значение имели публиковавшиеся в «Уфимских епархиальных ведомостях» проповеди архиерея. Помимо церковно-исторических трудов Иустин на протяжении всей жизни писал стихи – молитвенные и духовные размышления о жизни (неизданными остались «Мои мысли, воздыхания и желания под рязанскими зорями и уфимскими ночами»). Полное собрание сочинений Иустина вышло в 12 обширных томах (М., 1895 г., тома 1–10; Рязань, 1896, 1897 гг., тома 11 и 12).