15 мая 1715 г. по указу царевны Марии Алексеевны соловецкому архимандриту Фирсу построенная на Голгофе церковь была освящена в честь Страстей Господних. Под горой, у бывшей кельи иеродиакона Паисия, пустынники определили место для скитского кладбища. Первые и самые значительные вклады в строящийся Голгофо-Распятский скит поступили от членов царского дома: Пётр I повелел ежегодно отпускать из архангельских государственных магазинов хлеб для братии, царица Параскева Фёдоровна, вдова царя Иоанна V Алексеевича, пожаловала на строительство церкви 100 руб., царевна Мария Алексеевна пожертвовала церковную утварь, облачения и книги, а также образ-мощевик Успения Божьей Матери в серебряной ризе с позлащёнными полями и напрестольный сребропозлащённый крест со св. мощами. Преподобный Иисус составил для Голгофского скита строгий общежительный устав, по которому насельникам запрещалось вкушать скоромную пищу, рыбу и вино, не разрешалось иметь личное имущество. Помимо общего иноческого правила полагалось ежедневно в кельях читать пять кафизм Псалтири, 500 Иисусовых молитв и делать 300 поклонов. Женщины и отроки в скит не допускались. К 1718 г. в скиту жили 13 человек помимо пустынников, подвизавшихся в уединённых кельях и приходивших в скит каждое воскресенье на богослужение. В 1718 г. Голгофо-Распятский скит был разграблен разбойниками, насельники разбежались. Когда скитяне вернулись, святой упрекнул их за малодушие, и иноки дали обещание не покидать обитель ни при каких обстоятельствах. Преподобный Иисус при жизни прославился чудотворениями, исцелениями больных: он не только молился о них, но и перевязывал им раны, мазал их св. елеем. Святой исцелил инока, обуреваемого блудной страстью. В Житии Иова, помещённом в Соловецком патерике, рассказывается о том, что молитва старца часто останавливала воров; злоумышленники раскаивались и оставались трудниками в скиту. В скиту не было источника воды – братии приходилось поднимать её из озера под горой, из-за чего многие роптали. Старец молился Богу и Пресвятой Богородице об обретении в скиту источника. Во время молитвы преподобному явилась Пресвятая Богородица и указала место для колодца (источник существовал до 1828 г., когда при строительстве новой каменной церкви на Голгофе он был засыпан). За год до кончины преподобный Иисус начал приготовления к возведению в Голгофо-Распятском скиту каменного храма и заплатил строителю Свято-Троицкого скита Герману за строительные материалы. В связи с переводом Германа в другой монастырь приготовления прекратились. Незадолго до кончины преподобный Иисус просил новоназначенного строителя Свято-Троицкого скита Спиридона продолжить работы и передал на строительство храма 236 руб., 1 алтын и 2 деньги, иеромонаху Филарету, монаху Проклу и послушнику Онисиму старец на те же цели оставил 100 червонных и 38 руб. Преподобный предузнал день своей кончины. Перед смертью просил учеников совершить его погребение без участия мирян, что и было исполнено. Тело старца похоронили на Голгофе в каменном склепе, над которым поставили деревянную гробницу, сверху положили доску с записью основных событий жизни Иова и с изображением лика преподобного.