Средние сыновья Фабий (Флавий) и Феодосий не могли активно участвовать в политической жизни, т.к. родились нездоровыми: у одного была свёрнута набок голова, другой был глухонемым. Исследователи полагают, что судьбы Фабия и Феодосия стали причиной переживаний для Ираклия I и всего двора и предметом насмешек для недоброжелателей. По свидетельствам позднейших источников, византийцы якобы говорили, что нездоровые дети Ираклия I – это кара за незаконный брак. До 626 г. родились также дочери Августина и Мартина. В 626 г., во время похода Ираклия I в Закавказье, родился Ираклона (Ираклий Младший, Константин). В 630 г. родился Давид и ещё позже – Марин (оба кесари с 638 г.). Исследователям известно также о смерти двух сыновей (по мнению исследователей, Константина Младшего и Фабия) и двух дочерей (имена исследователям неизвестны) Ираклия I в период его персидской кампании (до 628 г.). Большинство детей к моменту смерти Ираклия I были живы, обладали различными титулами, в 641 г. стали жертвами политического кризиса. Важным направлением деятельности правительства Ираклия I было укрепление сотрудничества с церковью. В Константинополе одним из главных его помощников стал патриарх Сергий, который безоговорочно перешёл на сторону нового императора. В интересах государства, понимая сложность положения Ираклия I, патриарх Сергий неизменно одобрял и проводил в жизнь многие, даже непопулярные меры, в том числе законы о сокращении штатов церковного клира и конфискации богатств храмов и монастырей. Поддерживал Ираклия I и знаменитый в то время Феодор Сикеот из Галатии, который совершал путешествия в Константинополь для встреч с Ираклием I, принимал императора в своём монастыре и благословлял его на войну с персами. Вскоре после смерти Феодора (ум. 22 апреля 613 г.) его мощи были перенесены патриархом Сергием в Константинополь. В 612/613 г. на колонну императора Фоки во время богослужения в Константинополе был воздвигнут крест как знак приверженности правления Ираклия I традициям благочестия. В дальнейшем с укреплением власти Ираклия I почитание креста становилось всё более важным элементом государственной идеологии. К моменту начала правления Ираклия I положение Византийской империи было чрезвычайно тяжёлым. Захват власти императором Фокой в 602 г. как предлог для начала военных действий против Византии использовал персидский шах Хосров II Парвиз (590–628 гг.). К началу 610 гг., в ходе продолжительной Византийско-персидской войны (конец 602 г. – апрель 628 г.) персам удалось полностью разрушить пограничную оборону византийцев в Северной Месопотамии и Сирии, овладеть большинством крепостей. Положение усугубилось гражданской войной в Византии в 608–610 гг., которая привела к уменьшению численности войск на восточных границах. В результате уже после вступления Ираклия I на престол в 611 г. полководец Хосрова Фаррухан Шахрбараз овладел крупнейшими городами Сирии: Антиохией, Эдессой и Апамеей. Но после переворота императора Фоки в 602 г. была ослаблена пограничная оборона византийцев на Дунае; началось интенсивное проникновение славянских племён и аваров на Балканский полуостров. К началу правления Ираклия I был утрачен контроль над большей частью континентальных районов Балкан, под властью византийцев оставались, в основном,