Среди старопечатных книг были «Лимонарь, сиречь Цветник», напечатанный в Киево-Печерской типографии в 1628 г.; напрестольное Евангелие московской печати 1634 г. (книга обложена зелёным бархатом; наугольники сребропозлащённые черневой работы; застёжки сребропозлащённые чеканной работы); и др. Большая часть рукописей и печатных изданий относились к XVIII в. и в особенности к XIX – началу XX вв. Важнейшим источником сведений по истории Оптиной пустыни является летопись, которая велась в скиту Иоанна Предтечи с 1820 по 1918 гг., за исключением 1861–1864 и 1883–1899 гг., и также хранилась в скитской библиотеке (отдел рукописей Российской государственной библиотеки). В летописи фиксировались состав и перемещение братии скита Иоанна Предтечи, постриги, посвящения в сан, кончина монашествующих, возведение построек в скиту Иоанна Предтечи и в монастыре, праздничные богослужения, послушания, приезд известных людей, крупные пожертвования, выход в свет подготовленных монахами книг, чудеса, погодные явления, а также «особенно важные и выдающиеся события в церковной и политической жизни России» и др. Летопись велась по благословению и под наблюдением старцев. Среди её составителей в разные годы были преподобный Макарий, иеромонах Леонид, иеродиакон Антоний (Глушков), иеродиакон Палладий (Белоусов), монах Порфирий (Севрюгин), иеромонах Евфимий (Трунов), преподобный Варсонофий, рясофорный монах Иоанн (Полевой), рясофорный монах Александр (Аваев), иеродиакон Кирилл (Конардов; в литературе он нередко ошибочно идентифицируется с иеродиаконом Кириллом (Зленко), архимандрит Поликарп (Соловьёв) и др. В 2008 г. летопись была опубликована, но не полностью. С 1840 гг. по инициативе Макария и при поддержке митрополита Филарета (Дроздова) многие насельники скита Иоанна Предтечи (преимущественно выходцы из дворян, имевшие хорошее образование), в том числе преподобный Амвросий, иеромонахи Леонид и Ювеналий (Половцев), участвовали в просветительной деятельности обители. Они переписывали и издавали (в переводе Паисия или в собственных переводах) творения отцов церкви (преподобных Варсонофия Великого, аввы Дорофея, Марка Подвижника, Иоанна Лествичника, Симеона Нового Богослова, Феодора Студита, Максима Исповедника, Исаака Сирина, Иоанна Дамаскина, Нила Сорского и др.), публиковали жизнеописания оптинских старцев и других подвижников XVIII–XIX вв., переписку старцев, исторические описания монастырей и др.