В 876 г., также по инициативе Карла Лысого, на кафедру Буржа был переведён из Бордо сторонник короля Фротарий, которому, впрочем, удалось занять кафедру только после вмешательства Собора и папы Иоанна VIII (872–882 гг.), т.к. аквитанский маркграф Бернард Готский выступил против нового архиепископа и отказался впустить его в город, закрыв перед ним ворота. В конце X в. архиепископы Буржа полностью поддержали королей династии Капетингов. В 991 г. архиепископ Дагберт выступил против Арнульфа, архиепископа Реймсского, защищавшего права последнего представителя династии Каролингов Карла Лотарингского. В 998 г. Дагберт также оказал поддержку королю Роберту II Благочестивому, брак которого с Бертой Бургундской был оспорен папой Григорием V (996–999 гг.). Опираясь на королевскую поддержку, архиепископы Буржа вели себя независимо по отношению к Риму: в 1077 г. архиепископ Рихард II открыто выступил на Соборе в Отёне против папского легата Гуго из Ди, за что ненадолго был лишён архиепископского сана. С именем Рихарда II, который проявил себя ревностным защитником интересов церкви и добился возвращения её имущества, захваченного прежде светскими сеньорами, связано начало борьбы архиепископов Буржа за первенство во всей Аквитании. Он стал первым архиепископом, официально провозгласившим себя примасом (первенствующим епископом) Аквитании и потребовавшим подчинения со стороны архиепископов Бордо и Оша. Папа Римский Пасхалий II (1099–1118 гг.) в 1112 г. признал за архиепископом Леодегарием право первенства над митрополитами Оша (Гасконь) и, вероятно, Бордо. Это положение неоднократно подтверждалось папами Евгением III (1145–1153 гг.), Иннокентием II (1130–1143 гг.), Иннокентием III (1198–1216 гг.), Гонорием III (1216–1227 гг.), и Григорием IX (1227–1241 гг.), но архиепископы Бордо, опираясь на поддержку английских королей, не признавали его и игнорировали все призывы явиться на Соборы, созывавшиеся архиепископами в Бурже. Со второй половины XII в. Римские папы постепенно установили свой контроль над кафедрой Буржа. В 1141 г. папа Иннокентий II без ведома короля Людовика VII (1137–1180 гг.) назначает архиепископом Буржа Петра де Ла Шатра, что стало причиной конфликта между новым епископом и королём, который отказался признать папского ставленника и назначил вместо него Кадурка, аббата монастыря св. Сульпиция в Бурж. При архиепископе Генрихе де Сюлли (1183–1200 гг.) была начата реконструкция кафедрального собора св. Стефана в готическом стиле (закончен около 1320 г.; в 1992 г. собор св. Стефана в Бурже был включён в список памятников всемирного культурного наследия ЮНЕСКО). Архиепископ Вильгельм Донжонский, а также его преемники Герард (Жиро) де Кро и Симон де Сюлли принимали участие в походах на юг Франции против альбигойцев. Конец попыткам архиепископов Буржа установить свой примат в Аквитании положила булла папы Климента V (1305–1314 гг.; бывшего архиепископа Бордо) от 27 ноября 1305 г., согласно которой архиепископ Бордо полностью уравнивался в правах с архиепископом Буржа, обладая правом первенства в Западной Аквитании, в то время как архиепископ Буржа сохранял его в Восточной Аквитании.