Таким образом, юрисдикция архиепископства Буржа ограничивалась теми рамками, которые оно имело в римскую и меровингскую эпохи, совпадая с провинцией Аквитания I. В его состав вошло семь епископств: Ле-Пюи, Манд, Клермон, Альби, Кагор, Лимож и Родез. В 1318 г. папа Римский Иоанн XXII (1316–1334 гг.) создал в пределах архиепископства Буржа четыре новых епископства: Сен-Флур, Тюль, Кастр и Вабр. В период схизмы в католической церкви архиепископы Буржа поддержали авиньонских антипап Климента VIII (1423–1429 гг.) и Бенедикта XIII (1394–1417 гг.). При короле Карле VII (1422–1461 гг.) Бурж стал местом проведения крупных церковно-политических собраний. В 1432 г. здесь состоялся Собор духовенства Франции, имевший целью реформирование католической церкви. Епископы Франции высказались в поддержку действий Базельского собора и признали низложение папы Евгения IV (1431–1447 гг.). В 1438 г. на церковно-политической ассамблее была провозглашена Буржская Прагматическая санкция, ограничивавшая власть папы над французским духовенством. В 1440 г. Собор в Бурже признал папу Евгения IV, но отказался аннулировать Прагматическую санкцию, дававшую клирикам право свободного выбора епископа. Но уже Людовик XI (1461–1483 гг.), воспользовавшись разногласиями среди членов соборного капитула, назначил архиепископом своего духовника Пьера Кадуэ. Так же поступил Людовик XII (1498–1515 гг.), назначив в 1505 г. архиепископом Буржа своего незаконнорожденного сына Мишеля де Бюси. Тем не менее, капитул Буржа резко восстал против Болонского конкордата 1516 г., фактически передававшего права назначения епископа в руки короля, и в 1520 г. вопреки желанию короля Франциска I (1515–1547 гг.) избрал архиепископом Франциска де Бюэй. Король отказался признать это избрание и конфисковал имущество архиепископства, но это не изменило решение соборного капитула, поддерживавшего избранного им архиепископа. После его смерти (1525 г.) лишь вмешательство папы Климента VII (1523–534 гг.) заставило буржских каноников принять ставленника Луизы Савойской Франциска де Турнона, с этого времени соборный капитул потерял контроль над выборами архиепископа. Распространение протестантизма в Бурже связывается с деятельностью в 1520 гг. духовника королевы Маргариты Наваррской Мишеля д'Аранда. При короле Генрихе II (1547–1559 гг.) в шести населённых пунктах архиепископства, в том числе в Бурже, существовали протестантские церкви. В 1562 г., узнав о захвате Орлеана гугенотами во главе с принцем Конде, католики Буржа организовали ополчение.