На стадии формирования учения внутри движения методистов происходили неизбежные споры. Джон Уэсли разделял взгляды голландского богослова Якоба Арминия (1560–1609 гг.), который акцентировал внимание на решающей роли свободы воли в деле спасения души. Ярко выраженный арминианский характер разработанных Джоном Уэсли доктринальных документов привёл к отделению от общего движения методистов группы, возглавляемой его ближайшим соратником Джорджем Уайтфилдом, которая придерживалась кальвинистской доктрины о предопределении. Эти взгляды разделили и другие его оппоненты внутри методистов, например, Хауэл Харрис (1714–1773 гг.) и Селина Гастингс (1707–1791 гг.), графиня Хантингтонская. В 1783 г. Селина Гастингс основала несколько общин, которые впоследствии получили название «Объединение Хантингтонской графини» и отделились от методизма. Большинство современных методистов идентифицируют своё учение с арминианской концепцией свободной воли, которая даруется освящающей благодатью. Джон Уэсли осознавал необходимость сохранения священства: он настаивал на получении от Англиканской Церкви Англии рукоположённых священников для совершения таинств. Но после того как англиканские епископы решительно отказались посвящать в священнический сан приверженцев методистского движения, Джон Уэсли сам посвятил одного из своих последователей в суперинтендента с правами епископа, чем положил начало методистскому священству. И всё же, несмотря на свои радикальные действия, Джон и Чарльз Уэсли, основавшие методизм, так и не вышли из Церкви Англии. Пережив многих соратников по движению, Джон Уэсли скончался 2 марта 1791 г. Он вошёл в историю церкви как классик и вдохновитель ревайвализма («revival» – «возрождение, пробуждение») – реформации жизни, а не учения, т.к. его деятельность была направлена на поднятие духовного и морального уровня христианской церкви, а не на перестройку её богословского учения. Лишь после смерти Джона Уэсли последователи его идей приступили к созданию независимой религиозной организации. В 1795 г. в Великобритании в соответствии с так называемым планом умиротворения власти признали методизм как самостоятельную протестантскую церковь. Движение методистов наиболее быстро распространялось в Англии: в 1788 г. численность методистов достигла 78 тыс. человек, в 1821 г. – 215 тыс., в 1861 г. насчитывалось уже 513 тыс., а в 1906 г. – 800 тыс. методистов. Рост методистских общин наблюдался также в Ирландии, Уэльсе и Шотландии.