Среди чудес Макария есть также чудо о спасении от смерти осуждённого на казнь павликианина (см. ст. Павликиане), который единственный из своих единомышленников раскаялся в ереси. Во время нового гонения на почитателей икон при императоре Льве V (813–820 гг.; второй период иконоборчества) Макарий проявил себя как стойкий приверженец православия и бесстрашный обличитель еретиков. По приказу императора Макарий был заключён в темницу, где не поддался на обещание богатств и почестей взамен отречения от поклонения иконам. Там же в споре с иконоборческим богословом Иоанном Грамматиком (будущий Константинопольский патриарх Иоанн VII Грамматик) Макарий подтвердил своё непреклонное следование иконопочитанию, после чего был отправлен в изгнание. После убийства Льва V Макарий был освобождён. Основал монастырь на берегу Пропонтиды (Мраморного моря) вместе с сосланным туда бывшим Константинопольским патриархом Никифором. Макарий полностью разделял позицию патриарха относительно того, что клирики, примкнувшие к ереси иконоборчества, даже после покаяния не могут быть восстановлены в сане. В Житии рассказывается, что после того как некий священник, извергнутый из сана, принёс покаяние и вновь стал служить литургию, в приобщавшихся от него вселялись бесы. При императоре Феофиле Макарий вновь был арестован и принуждён к полемике с эпархом-иконоборцем, которая подробно приведена в Житии. По примечанию Т. Сениной, суть беседы заключалась не в попытке переубедить Макария, а в том, чтобы иконопочитатели не пренебрегали литургическим общением с иконоборцами. При Феофиле Макарий был сослан на остров Афусия, где он восстановил полуразрушенный храм при помощи местных жителей. В конце жизни изнуряемый болезнью Макарий предчувствовал, что скоро придёт его час предстать перед Богом. Он сам выбрал место своего погребения на Афусии и поручил двум ученикам изготовить для него усыпальницу. Как только гроб был готов, подвижник мирно скончался. Посмертные чудеса преподобного, в основном, связаны с избавлением от демонов людей, оказавшихся на Афусии и приведённых к его гробнице, в одном чуде подвижник обличает распутную женщину. В Житии нет чётких указаний на дату рождения Макария. Исходя из того, что он был рукоположён во иерея патриархом Тарасием (784–806 гг.), и ему должно было быть не меньше 30 лет (канонический возраст рукоположения), исследователи полагают, что он родился не позже 776 г.