По штату денежное содержание Митрофанова Воронежского монастыря было скромным. Основные доходы монастырю приносили пожертвования от паломников, приезжавших поклониться мощам святителя. Однако монастырь был настолько тесно связан с архиерейским домом, что отделить доходы обители от доходов епархии для исследователей затруднительно. Встречается лишь приблизительная оценка доходов Митрофанова Воронежского монастыря в период правления Воронежского и Задонского епископа Вениамина (Смирнова; 1886–1890 гг.), содержащаяся в памфлете, вероятным автором которого был Никита Петрович Гиляров-Платонов. В памфлете утверждалось, что епископ «получает до 25 000 рублей дохода от воронежского Митрофаниева монастыря».