В 1210/1211 и 1212 гг. Мстислав Мстиславич совершил победоносные походы на чудь (эстов). В 1212 г. принял участие в событиях в Южной Руси. Киевский князь из черниговской ветви Ольговичей Всеволод Святославич решил изгнать из Киевской земли двоюродных братьев Мстислава Мстиславича, «Ростиславлих внуков» Ростислава и Владимира Рюриковичей; они обратились за помощью к Мстиславу Мстиславичу и другому своему кузену, Смоленскому князю Мстиславу Романовичу. Мстислав Мстиславич с новгородцами отправился в поход, но под Смоленском произошла ссора между новгородцами и смолянами, после чего новгородцы отказались идти дальше, и Мстислав Мстиславич продолжил поход только со своим двором. Однако посадник Твердислав уговорил новгородцев догнать князя и присоединиться к нему. Военные действия под Киевом закончились успешно для «Ростиславлих внуков»: Всеволод Святославич бежал в Чернигов, и в Киеве был посажен Мстислав Романович Смоленский. Затем союзники двинулись к Чернигову и после 12 дней стояния под городом заключили с черниговскими князьями мир («Новгородская Первая Летопись»). В 1215 г. Мстислав Мстиславич оставил княжение в Новгороде и отправился в Южную Русь. Сменивший его благоверный князь Ярослав (Феодор) Всеволодович, брат Владимирского великого князя мученика Георгия (Юрия) Всеволодовича, вскоре вступил в конфликт с новгородцами, и в начале 1216 г. новгородцы вновь призвали к себе на княжение Мстислава Мстиславича. Вернувшись в Новгород, Мстислав Мстиславич начал военные действия против Ярослава (Феодора) Всеволодовича. Вскоре они переросли в крупную войну, где вместе с Мстиславом Мстиславичем и новгородцами выступали смоляне и псковичи со своими князьями, а также старший брат Юрия и Ярослава Всеволодовичей Ростовский князь Константин Всеволодович, а на стороне Ярослава – его братья Юрий, Святослав и Владимир. 20–21 апреля в Липицкой битве близ Юрьева-Польского, в пределах Суздальской земли, Мстислав Мстиславич и его союзники наголову разбили противников. Повесть о битве на Липице, вошедшая в состав новгородско-софийских летописей, особо подчёркивает доблесть командовавшего войском победителей Мстислава Мстиславича, который проехал «сквозе полкы княжи Юрьевы и Ярославли, секучи люди, бе бо у него топоръ с паворозою на руце, и тем сечааше». Затем союзники подступили к Владимиру, после чего Юрий Всеволодович капитулировал, и на владимирский стол был возведён его брат Константин («Полное собрание русских летописей», том 6, «Новгородская Первая Летопись»). Весной 1217 г. Мстислав Мстиславич оставил Новгород, вскоре после этого близкий к нему Антоний был лишён новгородцами кафедры, на которую вернулся Митрофан.