Рядом с Межигорским в честь Преображения Господня монастырём было семь мельниц. Две были устроены на плотинах и на ручьях, текущих с гор, одна – на ручье Мощун, четыре мельницы располагались на реке Горенке. Монастырская вотчина в Киевской сотне Киевского полка включала сёла Вышгород (12 дворов, 25 бездворных хат), Новые Петровцы (62 двора и одна бездворная хата), Лютеж (18 дворов и одна бездворная хата), деревни Старые Петровцы (23 двора и три бездворные хаты) и Борки (21 двор и четыре бездворные хаты). Обитель также владела сёлами Чернин (35 дворов, четыре бездворные хаты), Евминка со слободкой Красулька (135 дворов, четыре бездворные хаты) и слободкой Юсковая Гребля (девять дворов и бездворная хата) в Остёрской сотне Киевского полка. Во всех сёлах и слободках Межигорского в честь Преображения Господня монастыря в шинках продавали «горячее вино», мёд и пиво. Со всех монастырских угодий поступило доходов: в 1771 г. – 3378 руб. 29 коп., в 1772 г. – 2722 руб. 17 коп., в 1773 г. – 2593 руб. 54 коп. В 1771 г. в Запорожской Сечи Межигорский в честь Преображения Господня монастырь доходов не получил из-за эпидемии чумы. В 1772 г. монахи собрали пожертвований на 2447 руб. и 34 червонца, а также 910 рун овечьей «вовны», рыбу. Таким образом, годовая финансовая помощь Сечи почти равнялась годовой прибыли Межигорского в честь Преображения Господня монастыря от использования своих угодий. Межигорский в честь Преображения Господня монастырь получал доходы и из приписного Самарского монастыря, расположенного на землях Низового Запорожского войска. В 1770 гг. в этом монастыре содержалось 155 коней, 266 волов и коров, овцы, бараны, козы; были четыре пасеки с 503 ульями, четыре мельницы. В 1771 г. Межигорский в честь Преображения Господня монастырь получил из Самарского монастыря 900 рун овечьей «вовны», 60 «чорних смушков», 12 пудов воска, две бочки сыра, бочку масла, в 1773 г. – 18 пудов воска, 22 вола, три бочки сыра, бочку масла, четыре бочки мёда, 16 четвертей пшена, 611 рун овечьей «вовны». Монастырские подворья находились в Киеве, Переяславе, Козельце и Остре. Исследователям наиболее известно Киевское подворье, основанное в 1615 г. на Подоле во дворе мещанина Б. Гребениковича. На протяжении XVII–XVIII вв. подворье увеличивалось благодаря присоединению окружающих земельных участков. В 1631 г. бывший настоятель Воскресенской церкви Киевский митрополит Иов (Борецкий), поддерживавший связи с казачеством, завещал Межигорскому в честь Преображения Господня монастырю Черкашенковский двор, купленный им в 1617 г. Из-за этого двора в 1637 г. его дочь инициировала судебное дело против монастыря.