Также он организовал строительство несколько храмов, при которых были открыты католические школы. В 1857 г. папа Римский Пий IX возвёл Г.Э. Маннинга в достоинство прелата папского двора, назначил провостом Вестминстерского собора в Лондоне. Активность Г.Э. Маннинга вызывала критику со стороны некоторых английских католиков, в том числе Трапезундского епископа Джорджа Эррингтона, коадъютора Вестминстерского архиепископа Николаса Уайзмена, а также Дж. Г. Ньюмена, чья деятельность была ориентирована на образованные круги английского общества, в то время как Г.Э. Маннинг призывал развивать миссионерскую деятельность среди бедных слоёв населения, уделять больше внимания подготовке приходских священников в английских католических духовных семинаиях. Между Г.Э. Маннингом и Дж. Г. Ньюменом развернулась дискуссия по вопросу о сохранении светской власти папы Римского, где Г.Э. Маннинг отстаивал идею независимости Папского государства как условия независимости Римско-католической церкви от светских властей. После смерти архиепископа Николаса Уайзмена 16 мая 1865 г. папа Пий IX вопреки решению капитула Вестминстерского собора и рекомендации Конгрегации пропаганды веры назначил Г.Э. Маннинга архиепископом Вестминстерским. Епископское рукоположение Г.Э. Маннинга, состоявшееся 8 июня того же года в лондонской церкви Пресвятой Девы Марии, возглавил Бирмингемский епископ Уильям Аллаторн. В годы своего правления Г.Э. Маннинг способствовал укреплению английского католицизма, добившись влияния в политической и общественной жизни Англии. В конце 1860 гг. активно выступал за лишение Ирландской епископальной церкви государственного статуса (disestablishment) в Ирландии, подавляющее число жителей которой составляли католики. Позицию Г.Э. Маннинга поддержал премьер-министр У.Ю. Гладстон. Высказанные Г.Э. Маннингом в памфлете «Письмо графу Грею» («Letter to Earl Grey», 1868 г.) доводы использовались в ходе парламентских дебатов, по итогам которых в 1869 г. государственный статус Англиканской церкви в Ирландии был упразднён (с 1871 г.). Г.Э. Маннинг уделял особое внимание развитию католического образования; к началу 1890-гг. в католических школах Англии обучалось около 70 тыс. человек. Выступая против политики деконфессионализации английского образования, начавшейся после «Акта о начальном образовании» 1870 г., Г.Э. Маннинг оказывал поддержку консерваторам. В 1885 г. по распоряжению Г.Э. Маннинга в католических газетах были опубликованы инструкции по голосованию на парламентских выборах, что должно было обеспечить поддержку политикам, требовавшим отменить реформу образования. Стремясь обеспечить возможность получения университетского образования для католиков, Г.Э. Маннинг направил в Рим петицию о допустимости посещения католиками Оксфордского и Кембриджского университетов, однако в 1867 г. Папский престол негативно отнёсся к данной инициативе.