В 1849–1856 гг. настоятелем был архимандрит Иоасаф, бывший инспектор Минской духовной семинарии. При нём в 1850 г. завершилось строительство каменного жилого корпуса. В 1856–1874 гг. Ляданский монастырь находился в ведении ректоров Минской духовной семинарии, под непосредственным управлением её казначеев или экономов. С 1856 г. обязанности настоятеля исполнял архимандрит Николай (Трусковский), ректор Минской духовной семинарии, автор «Историко-статистического описания Минской епархии» (1864 г.). В 1874 г. ректор семинарии архимандрит Ианнуарий (Попов-Вознесенский) передал дела управления Ляданского монастыря игумену Адриану (1874–1876 гг.). В 1877–1878 гг., при настоятеле игумене Всеволоде, по благословению Минского и Туровского епископа Евгения (Шерешилова) был произведён ремонт Благовещенской церкви: заменена крыша, возведён купол, увеличен иконостас, обновлена роспись. Работы велись за счёт монастырских средств, древесина поставлялась из лесной дачи. 20 августа 1878 г. состоялось освящение храма. По мнению исследователей, к этому времени относится устроение в нём придела во имя псковского святого князя Всеволода (Гавриила) Мстиславича. В 1888 г. обрушился внутрь купол Благовещенской церкви, богослужения стали совершать в придельной Троицкой церкви. По просьбе управляющего иеромонаха Илария из казны было отпущено больше 10 тыс. руб. на восстановительные работы. 16 июля 1900 г. храм был освящён епископом Минским и Туровским Михаилом (Темнорусовым). Тогда же был возведён новый иконостас с «иконами хорошего письма». В 1900–1904 гг. в монастыре проживали три иеромонаха и три иеродиакона, должность настоятеля была вакантной. Управляли обителью иеромонах минского в честь Сошествия Святого Духа на апостолов монастыря Иларий, в 1904 г. – иеромонах пинского Богоявленского монастыря Донат. К 1908 г. в обители проживали игумен, пять иеромонахов, два иеродиакона, два монаха, три штатных послушника и пять внештатных. При Ляданском монастыре действовала школа грамоты. Монастырь получал на содержание из государственной казны 1840 руб. В 1915 г., при настоятеле игумене Феодосии, Ляданский монастырь собирал и жертвовал денежные средства на военные нужды и в пользу Красного Креста. К началу XX в. богослужения в Ляданском монастыре совершались по монастырскому уставу: утренняя служба начиналась в 6 часов утра, литургия в будние дни – в 9 часов, а в дни великих праздников – в 10 часов. По субботам, кроме Пасхальной недели и двух недель Рождества Христова, настоятель служил заупокойную литургию и панихиду с поминанием иерархов, бывших настоятелей, братии. В торжественные дни до литургии настоятель в сослужении двух либо четырёх иеромонахов читал акафист перед Ляданской иконой Божьей Матери. Важными праздниками были Рождество Иоанна Предтечи, дни памяти апостолов Петра и Павла. 29 июня совершался крестный ход на Базарную пл., в часовню, где находилась резная Ляданская икона Божьей Матери. Последними настоятелями Ляданского монастыря были иеромонах Ириней (1916–1919 гг.) и архимандрит Гавриил (Горбач; 1919–1922 гг.), арестованный в 1933 г. за «принадлежность к контрреволюционной организации».