По решению Папского престола к латинскому патриархату Антиохии было присоединено епископство Триполи (основано в 1110 г.), тогда как Тир, Берит, Сидон и Акра отошли латинскому патриарху Иерусалима. Латинский патриарх Антиохии играл заметную роль как в международных отношениях на Ближнем Востоке, так и в непосредственном административном управлении. К концу XII в. территория патриархата расширилась за счёт острова Кипр. В ходе противостояния Раймонда Рубенида с Боэмундом IV последний (также находясь в конфликте с Папским престолом) в 1206 г. изгнал латинского патриарха, поставив на его место православного иерарха, но после примирения с папой Римским в 1209 г. кафедру Антиохии вновь занял латинский патриарх. После взятия Антиохии мамлюками в 1268 г. патриарх Опицо деи Фьески бежал в Рим. С этого времени латинский патриархат Антиохии стал номинальным; резиденция титулярных латинских патриархов Антиохии находилась в Риме, в базилике Санта-Мария-Маджоре. С 1953 г. престол латинского патриарха Антиохии оставался вакантным, в январе 1964 г. папой Римским Павлом VI (1963–1978 гг.) титул был упразднён. Латинский патриархат Константинополя (лат. Patriarchatus Constantinopolitanus Latinorum) был основан после взятия Константинополя войсками крестоносцев (1204 г.) и основания Латинской империи в Константинополе. В связи с избранием императором Балдуина I венецианцам, не получившим светской власти, была предоставлена возможность избрать из своего клира патриарха на Константинопольский престол. Им стал субдиакон Томмазо Морозини (ум. в 1211 г.), на тот момент отсутствовавший в городе. В послании от 21 января 1205 г. папа Римский Иннокентий III (1198–1216 гг.) не признал каноничность этих выборов, но поскольку Томмазо Морозини на них не присутствовал, папа не счёл нужным осуждать его и подтвердил его титул. С 5 по 27 марта папа последовательно рукополагал Томмазо Морозини во диакона, священника и епископа, даровав ему 30 марта паллий. Кроме того, ему были предоставлены особые привилегии, например, право помазания королей. Папа существенно ограничил полномочия Константинопольского капитула, состоявшего исключительно из венецианцев, в избрании патриарха. Впоследствии большинство патриархов непосредственно назначались папами, хотя и являлись венецианцами. Также папа Иннокентий III добился возможности назначения в капитул не являвшихся венецианцами каноников (нередко из числа легатов), что, однако, лишь немного ограничило стремление Венецианской республики иметь собственную систему церковного управления, связанную со светской и с церковной (патриарх Градо) администрациями. При этом низшая иерархия латинского Константинопольского патриархата почти не претерпела изменений. На протяжении первых лет после завоевания не прекращались споры между «франкской» и венецианской партиями о разделе приходов и подчинении патриарху. Из-за этого преемник Томмазо Морозини был избран лишь на четвёртом Латеранском соборе (1215 г.), когда папа Иннокентий III утвердил «франкского» кандидата Гервасия (впрочем, также венецианца по происхождению). Тогда же было установлено первенство латинского патриархата Константинополя перед другими Латинскими патриархатами. Споры между двумя партиями возобновились после смерти Гервасия (1219 г.).