У Антония Кларета была ещё одна способность, свидетельствующая о его неординарных дарованиях. В кубинском городе Ольгине как-то организовывались народные гуляния. Главным номером программы был запуск воздушного шара, управляемого человеком, одного из первых в те времена аппаратов. Номер не имел успеха: шар начал подниматься, но пилот потерял контроль, и шар упал в небольшой овраг. Архиепископ, изучив этот вопрос, удивил всех: «Сегодня я понял систему управления воздушным шаром». И показал всем сделанный им и сохранившийся до сих пор чертёж, решающий проблему управления шаром. Антоний Кларет был человеком действия. Во всех приходах он основал религиозные и социальные учреждения для детей и взрослых; создал технические и сельскохозяйственные школы, разработал и внедрил по всей Кубе банковскую систему «касс сбережений», основывал приюты, четыре раза посетил все города, деревни и фермы своей необъятной епархии. Всегда пешком или верхом на лошади. Он умел окружить себя отличной группой опытных миссионеров, среди которых были известные тогда священники Адоаин, Лобо, Санмарти и Субирана. Одним из важнейших свершений Антония Кларета на Кубе (несмотря на множество трудностей) было основание женской монашеской Конгрегации Сестёр Непорочной Марии, позже принявших название Миссионерок Кларетинок. Соосновательницей новой общины стала сестра Антония Парис, которая принесла монашеские обеты 27 августа 1855 г. Эта дата считается днём основания конгрегации. Преследования Антония Кларета не прекращались даже на Кубе. Шквал покушений достиг своего апогея в городе Ольгине, где архиепископ был тяжело ранен при выходе из церкви наёмником своих недругов, которому незадолго до этого помог выйти из тюрьмы. Перед лицом смерти Антоний Кларет просил простить преступника. Но несмотря ни на что преследователи Антония Кларета не теряли его из вида, и покушения продолжались. В один из дней, после окончания шестилетнего пребывания Антония Кларета на Кубе, ему вручили срочный пакет от генерал-губернатора Гаваны. Её Величество Королева Изабелла II вызывала его в Мадрид. Это произошло 18 марта 1857 г. Прибыв в Мадрид, архиепископ Кларет узнал, что он назначен исповедником королевы. Вначале не соглашаясь, он всё же принял назначение, но с тремя условиями: не жить во дворце, не вовлекать его в политику и позволить ему свободно заниматься апостольской деятельностью. Когда Антоний Кларет возвратился с Кубы, ему было 49 лет. Все одиннадцать лет, что он провёл в Мадриде, архиепископ ни на минуту не прекращал проповеди Слова Божия.