Киевский губернатор Фёдор Матвеевич Воейков сообщил о ситуации в Синод; 18 октября вышел указ о выполнении распоряжений светской власти. Насельников, вынужденных оставить Кирилловский Свято-Троицкий монастырь, другие монастыри не принимали, и они разошлись по хуторам. В 1771 г. решили восстановить монастырь, но началась новая волна эпидемии: из 20 тыс. населения Киева погибло 6 тыс. По указу Синода «за изображённое преступление» братию и архимандрита в неурожайные 1770–1771 гг. было приказано держать некоторое время на хлебе и воде, архимандриту на период карательного поста было запрещено носить наперсный крест, мантию и митру. Архимандрит Кирилл умер 10 февраля 1783 г. Его отпевали епископ Никодим и настоятели всех киевских монастырей, многие приходские священники и братия Кирилловского Свято-Троицкого монастыря. По завещанию архимандрита Кирилла большая часть его средств жертвовалась на киевские обители для молитв за упокой души, а также родственникам (21 человек) и кирилловской братии (Центральный государственный исторический архив Киева). При последнем игумене Кирилловского Свято-Троицкого монастыря, Феодосии (1784–1786 гг.), в обители появилась больница, в которой работал дипломированный врач А. Салиман. Из сохранившихся документов исследователям известно, что в XVIII в. большинство насельников Кирилловского Свято-Троицкого монастыря были его пострижениками, около трети составляли иноки (часто неблагополучные), пришедшие с польской территории, из балканских государств и монастырей Святой Горы Афон, а также монахи, сосланные на покаяние. Выборочная статистика кирилловской братии такова: в 1720/1721 г. – десять иеромонахов, пять иеродиаконов; в 1730 г. – соответственно восемь и шесть; в 1739 г. – шесть и два; в 1741/1742 г. – всего 21 монах; в 1743 г. – 27; в 1744 г. – 23; в 1745 г. – 18; в 1756 г. – 19; в 1762 г. – 12; в 1770 г. – 23; в 1774 г. – 17. С 1775 г. фиксируется количество насельников: в этом году в обители было 20 монахов и 17 послушников, в 1777 г. – соответственно 16 и 30. До последнего года существования монастыря (1786 г.) в обители проживали от 18 до 22 насельников. В братии преобладали выходцы из низов (крестьяне, мещане, незначительное количество казаков), редко – обедневшие шляхтичи и купцы. Например, в 1773 г. было 13 крестьян, два мещанина, три насельника из купцов и шляхтич. Большинство братии были малороссами, исследователям известны случаи принятия в обитель униатов. Средний возраст иноков составлял 30–50 лет, мало кто доживал до 70; основные недомогания – подагра и болезни глаз. Как и во всех монастырях того времени, в Кирилловском Свято-Троицком монастыре были случаи пьянства, драк, воровства, побегов из обители (в соответствии со спецификой монастырских архивов проступки фиксировались, документация сохранилась). Лишь третья часть братии не подвергалась судам за проступки. В документах есть упоминание о схимнике (Михаил; 1764–1765 гг.). Среди послушаний особо выделяется сбор милостыни в Запорожье (сбор подаяний производился по специальному разрешению митрополита, главным образом, на строительные нужды или возобновление монастыря после пожара).