В 1243 г. Киракос Гандзакеци участвовал в церковном Соборе в Сисе (Киликия). В 1250 г. в Нор-Гетике он предал анафеме некоего мельника Давида, который вдруг стал провидцем и чудотворцем и заявил, что Христос якобы явился ему и сказал: «Обрати страну сию и совершай исцеления». Вслед за Ванаканом, который написал обличительное послание по этому поводу, Киракос Гандзакеци и епископ Амазасп Ахпатский составили обвинительные грамоты с угрозами и анафемой, требуя, чтобы Давид прекратил обманывать людей. В 1251 г. католикос Костандин I Бардзрабердци, получив от папы Римского Иннокентия IV письмо по поводу Символа веры и filioque, обратился к учёным мужам с просьбой высказаться по этому вопросу. Киракос Гандзакеци перечисляет имена деятелей Армянской Апостольской церкви, мнение которых в то время считалось авторитетным для католикоса Костандина I Бардзрабердци (Ванакан Вардапет, Вардан Аревелци, Овсеп и др.). В «Истории Армении» Киракос Гандзакеци приводит текст Символа веры армян и присоединяется к авторам послания католикосу. Учитывая активную деятельность и большой авторитет Киракоса Гандзакеци, после смерти Ванакана Вардапета в 1251 г., как полагают исследователи, он возглавил школу Нор-Гетика. В 1255 г. Киракос Гандзакеци встретился с королём Киликийской Армении Хетумом I, который возвращался после посещения ставок монгольких ханов Батыя и Мункэ. Встреча произошла «в селении Варденис, в доме ишхана, которого прозывали Курдом, армянина по происхождению и христианина по вере». Записав сведения о монголах со слов короля Хетума, Киракос Гандзакеци добавил их в «Историю Армении» к своим впечатлениям побывавшего в монгольским плену очевидца. Киракос Гандзакеци был знаком и со многими другими видными деятелями своего времени – с князьями Прошем, Григором, Курдом; его школьным товарищем был Вардан Аревелци, в 1265 г. по совету Киракоса Гандзакеци составивший комментарий на «Книгу Песнь Песней Соломона». В 1268–1269 гг. Киракос Гандзакеци побывал в Киликийской Армении и вернулся в Нор-Гетик. По сообщению Григора Акнерци, Киракос Гандзакеци умер в 720 г. по армянскому счислению лет (1271 г.), в один год с Варданом Аревелци. «Историю Армении» Киракос Гандзакеци начал писать в 1241 г., во время праздника Пятидесятницы (19 мая). Сочинение состоит из двух частей. Первая представляет собой компиляцию из текстов более ранних авторов, описывавших события с начала IV в. до 1197 г. По мнению исследователей, это – своеобразный обзор армянской истории со времени принятия христианства как государственной религии и до монголо-татарского нашествия.