1 мая 1930 г. на площади Ленина в центре Шуи была взорвана Спасская церковь (в 1961 г. на её территории установили памятник Ленину). Также были уничтожены Казанский собор в Плёсе (на его месте несколько десятилетий находилась танцплощадка), Тихвинская церковь в селе Холуй (позднее здесь возвели здание Холуйского художественного училища), Воскресенская церковь на площади Революции в Кинешме, Покровско-Тихоновский храм на Святыньке (близ Тихонова Лухского в честь Воздвижения Креста Господня мужского монастыря), стоявший на месте кельи Тихона Лухского, и др. Во второй половине 1930 гг. продолжилось закрытие храмов в городах, и началась массовая ликвидация сельских церквей. В 1937 г. были закрыты Ильинская церковь в городе Родники и Воскресенский собор в Шуе (тогда исчезла хранившаяся в соборе главная святыня Шуйского края – чудотворная Шуйская Смоленская икона Божьей Матери), в декабре следующего года прекратились богослужения в храме в честь Смоленской иконы Божьей Матери в городе Южа, в 1939 г. – в Никольском соборе в Приволжске, в 1940 г. – в Преображенской церкви в Иванове, после чего в областном центре не осталось ни одного действующего храма. В 1939–1941 гг. были ликвидированы церкви в сёлах Пеньки, Никола-Эз (Кинешемский район), Стрелка, Семигорье, Углец (Вичугский район), Плосково, посёлке Писцово (Комсомольский район), сёлах Зарайское (Пучежский район), Георгиевское (Пестяковский район), Парское, Сосновец (Родниковский район), Орехово (Сокольский район), Кибергино (Тейковский район), Красноармейское (Шуйский район), Соболево, Нежитино (Юрьевецкий район). В апреле 1941 г. закрыли Никольскую церковь – последний храм в Шуе. К 1941 г. ни одного действующего храма не осталось в районных центрах: Середе (Фурманове), Юже, Родниках, Лухе, Лежневе и др. К этому времени не совершались богослужения в главных храмах Кинешмы – в Троицком и Успенском соборах. Троицкий летний храм в Кинешме, 15 сентября 1936 г. по постановлению райисполкома переданный обновленцам, был закрыт 5 февраля 1938 г. В Успенском зимнем храме богослужения прекратились 1 ноября 1940 г., храм был закрыт по решению облисполкома от 24 января 1941 г. В 1936–1938 гг. в Ивановской области прошла новая волна террора, в том числе направленного против церкви. 8 марта 1936 г. был арестован митрополит Павел (Гальковский), обвинённый в том, что «возглавлял контрреволюционную группу реакционного духовенства и церковников», 21 июня архиерей был приговорён к ссылке в Казахстан. Сменивший митрополита Павла на Ивановской кафедре епископ Борис (Воскобойников) был арестован 23 апреля 1937 г., помещён во внутреннюю тюрьму НКВД в Ивановской области, 9 августа приговорён к пяти годам ссылки в Казахстан. В 1937–1938 гг. жертвами террора в Ивановской области стали десятки священников, в том числе протоиереи Иоанн Доброхотов, Фёдор Лбедев, Николай Бухарин, Пётр Лебедев, иереи Евфимий Тихонравов, Иоанн Коржавин, Пётр Зяблицкий, Иоанн Успенский, Константин Разумов и др. В 1939 г. в одной из тюрем Иванова скончалась бывшая настоятельница Воскресенско-Феодоровского монастыря Арсения (Добронравова). В 1938 г. в обстановке жестоких антицерковных гонений Ивановский епископ Алексий (Сергеев) отделился от патриаршего местоблюстителя митрополита Сергия (Страгородского) и провозгласил себя «автокефальным епископом Ивановской области». В 1939 г. епископ Алексий был запрещён в священнослужении и предан архиерейскому суду, в декабре следующего года принёс покаяние и был назначен на Тульскую и Одоевскую кафедру. Террор обрушился и на обновленцев. 17 марта 1936 г. в Иванове был арестован обновленческий «Ивановский митрополит» Александр Боярский, расстрелян 9 сентября 1937 г.