В 1676 г. Иосиф дал благословенную грамоту на построение церкви в честь Успения Пресвятой Богородицы в Успенской слободе Воронежа. В феврале 1679 г. по повелению митрополита на нижнем посаде в Переяславле Рязанском, близ кремля, началось возведение каменного, с трапезной Входоиерусалимского храма вместо деревянного. В конце 1670 гг. по благословению Иосифа в муромском во имя св. князей Бориса и Глеба монастыре началось строительство каменного Вознесенского собора с приделом во имя св. князей Бориса и Глеба взамен обветшавшей деревянной Борисоглебской церкви; в июле 1681 г. архиерей подписал для собора антиминс. По благословению Иосифа в 1678 г. некий Игнатий перевёл с польского языка краковское издание XVII в. «Годовых деяний... церковных... Цесаря Барония» (сокращение латинского текста 12-томных «Церковных анналов» Цезаря Барония, охватывающее историю церкви до XII в. включительно, выполнено иезуитом Петром Скаргой). Имя переводчика содержится в зашифрованном виде в послесловии к спискам Российской национальной библиотеки. В феврале 1679 г. архимандрит монастыря апостола Иоанна Богослова Рязанской епархии Иоасаф сообщил Иосифу, что находившийся в обители ссыльный монах Михаил (Микулин) вёл на трапезе в присутствии всей братии «раскольнические речи». Архимандрит Иоасаф передал Иосифу написанные Михаилом «семь столпов, в коих всякие непристойные речи о Пресвятом Божестве». Иосиф велел доставить Михаила в Переяславль Рязанский и в Неделю Торжества Православия «при всем народе о правоверии учил и обличал», но к покаянию не привёл. В апреле 1679 г. Иосиф послал Михаила и материалы следствия по его делу к патриарху, который повелел Рязанскому митрополиту сослать Михаила в монастырь и держать «под крепким началом», его сочинения были сожжены. По дороге из Москвы Михаил отказывался от пищи и, не доехав до Переяславля Рязанского, умер. В июне 1681 г., во время засухи в Рязанской епархии, Иосиф, находясь в Москве, повелел служить в рязанском Успенском соборе молебны, на литургиях «читать ектении о ниспослании благого дождя на землю, также в монастырях и уездах в ектениях молити и в среды и пятки петь молебны». Незадолго до кончины, в сентябре 1681 г., Иосиф участвовал в Соборе, созванном в Москве по инициативе царя для увеличения числа епархий в Русской церкви. Иосиф скончался в столице, на Рязанском архиерейском подворье (находилось на Лубянской площади). 22 сентября его отпел патриарх Иоаким в сослужении многочисленного духовенства. 30 сентября гроб с телом Рязанского митрополита водным путём был отправлен в Переяславль Рязанский, куда был доставлен 12 октября. Останки Иосифа были погребены в Архангельском соборе Рязанского кремля – усыпальнице Рязанских архиереев, в склепе между северо-западным столпом и северной частью западной стены.