Суд над Авраамием (к тому времени иеромонахом Крестовоздвиженского монастыря), обвинённым представителями смоленского духовенства в некой ереси и недостойной жизни, состоялся на епископском дворе. Оправданный князем и боярами, Авраамий с двумя учениками, тем не менее, был оставлен Игнатием под арестом (исследователи не исключают, что истинной целью этого решения было обеспечение их безопасности). На следующее утро Авраамий, запрещённый в священнослужении, был приговорён к высылке в пригородный Богородицкий монастырь на Селище, где он некогда принял постриг. Будущий Смоленский епископ Лазарь, бывший в то время священником, убеждённый в несправедливости наказания Авраамия, предсказал Игнатию Божье наказание Смоленску. Тогда «блаженый Игнатий... скоро посла по всем игуменом и к всем попом, заповедая и запрещая всем от всякого речениа зла престати, яже на блаженаго Авраамия: “Се бо, послушав вас, на ся от Бога въсприях в векы опитемью. А вы, чада, покайтеся”». Тем не менее, по-видимому, прещение с Авраамия тогда не было снято. Во время наступившей вскоре засухи (по данным дендрологического анализа, случившейся в 1210–1212 гг.) Игнатий с Собором духовенства и смолянами обходил город крестным ходом «с честным крестом и с иконою дръжащею Господа, и с честными святых мощьми», однако бедствие продолжалось. Лишь после беседы Игнатия с неким иереем – сторонником Авраамия (возможно, с Ефремом, автором Жития Авраамия) Игнатий «въскоре посла по блаженаго Авраамия, и призвав, и испытав, яко все лжа и оглаголание по зависти и злобе диаволи бысть, и прости и, глаголя: “И благослови, честный отче, за неведение мое се ти сътворих, и весь град благослови, и прости послушавших лживых клеветник и оглагольник”. И благослови пакы пречистую и честную литургию съвершати. “И моли Бога о граде и о всех людех, да помилуеть Господь и подасть богатно дождь Свой на земьлю”» («Библиотека литературы древней Руси», том 5). По молитвам Авраамия засуха прекратилась. В Житии Авраамия также рассказывается об основании Игнатием Авраамиева смоленского в честь Положения Ризы Пресвятой Богородицы во Влахерне мужского монастыря. Первоначально он предполагал воздвигнуть каменную церковь во имя Игнатия Богоносца «в память собе» и устроить при ней монастырь. Для этого он купил землю близ города, на которой поставил «церквицю во имя Богоносца... потом ту раздрушив и на ино место пресели, и основа болшу, и нарече во имя святое Владычица нашеа Богородица Положение честные Ризы и пояса. И быша в нем неколико братье, блаженым питаеми епископом Игнатием». Игуменом монастыря Игнатий поставил Авраамия. «Велику же любовь потом стяжаста блаженая: епископ радоваашеся, яко таковаго дарова ему Бог свята и блаженна мужа, Авраамий же радоваашеся, яко тако дарова ему Бог свята и блаженна епископа».