12 июля 1668 г. король Ян II Казимир, приняв во внимание жалобы сторонников Иосифа (Шумлянского), отменил избрание Евстафия Свистельницкого. Однако вступивший на польский престол в 1669 г. Михаил Вишневецкий 20 сентября 1670 г., 6 апреля 1671 г. и в 1673 г. подтвердил права Иеремии в отношении Львовской кафедры, отвергнув притязания Иосифа (Шумлянского). По мнению исследователей, позиция короля Михаила Вишневецкого была обусловлена резко негативным отношением польских властей к поддерживавшему Иосифа (Шумлянского) митрополиту Иосифу (Нелюбовичу-Тукальскому), который в 1668–1673 гг. вместе с Петром Дорошенко прилагал активные усилия к подчинению правобережного гетманства Османской Порте. В 1668–1673 гг. Иеремия вёл судебную тяжбу с Иосифом (Шумлянским) за Львовскую епархию, соперничавшие епископы совершали нападения на владения друг друга. Последствиями противостояния архиереев стали существенная дезорганизация епархиальной жизни и разделение духовенства и паствы на два лагеря. Отчётливо эти процессы отразились на епархиальном соборе, созванном Иосифом (Шумлянским) 26 апреля 1669 г. Из 37 наместников (протопопов) Львовской епархии большинство (21) не признавали власть Иосифа: на собор не прибыли пять протопопов Львовского, почти все (13 во главе с кафедральным протопопом) протопопы Галицкого и три (из пяти) протопопа Каменецкого (Подольского) генеральных наместничеств («крылосов»), сохранившие верность Иеремии и подчинявшиеся его генеральному наместнику («оффициалу») Михаилу Ловецкому. Епархиальный собор запретил в священнослужении иереев, получивших рукоположения от «пана Свистельницкого», собор также освободил от уплаты в пользу епископской кафедры налога – «куничего» («катедратика») – священников тех протопопий (наместничеств), которые отказались подчиниться Иеремии. Верные Иеремии протопопы были осуждены Иосифом (Шумлянским) и запрещены в служении, сторонников Иеремии Иосиф (Шумлянский) преследовал и отстранял от приходов и церковных должностей. В результате этих мер в начале 1670 гг. наметился переход части духовенства, в том числе протопопов, под власть епископа Иосифа (Шумлянского), хотя большинство православного духовенства Галичины и Подолья поначалу поддерживало Иеремию, управлявшего православными приходами в южной части Русского воеводства и частично в Каменецком наместничестве.