Признавая значение научных открытий, Чарльз Гор стремился сохранить авторитет церкви, водимой Святым Духом, определяя ей роль арбитра в споре Священного Предания и науки. В области догматики он выступал с позиций минимализма, отвергая нововведения католических богословов (учения о непорочном зачатии и о папской непогрешимости). Широкую известность Чарльз Гор получил после издания в 1889 г. сборника эссе нескольких английских богословов «Lux Mundi» («Свет миру»), посвящённого теории эволюции, современной философии и библейской критике. В сочинение «Святой Дух и богодухновенность» он рассматривал проблемы богодухновенности Священного Писания, пневматологии и христологии, в частности, учение о Боговоплощении как об основании христианской веры. Позже написал ряд монографий, в которых много места уделил проблеме Божественного кеносиса (самоуничижение через вочеловечивание). Вершиной его богословских трудов стала трилогия «Реконструкция веры» (1921–1924 гг.), каждый том которой посвящён одному из Лиц Пресвятой Троицы. Для богословия Чарльза Гора характерно переключение внимания с Крестной жертвы Спасителя на драму Боговоплощения в целом. По его словам, догмат о Боговоплощении нельзя интерпретировать символически. В основе христианской веры лежит именно историческое событие, которое подтверждается свидетельствами евангелистов. Христос является наивысшим образцом Божественного вхождения в мир. Его искупительное служение включает три аспекта: «Христос перед нами» – как Пример, Образец, «Христос для нас» – как Жертва, «Христос в нас» – как новая жизнь в Святом Духе. Церковь в её институциональной форме является продолжением Воплощения, поскольку она есть Тело Христово и передаёт верующим в таинствах Его благодать. Учение о добровольном кеносисе позволяет преодолеть внешний дуализм, характерный, по мнению Чарльза Гора, для халкидонского догмата (это стало причиной обвинения его в скрытом монофизитстве). Из его экзегетических работ выделяются толкования на Послания к Ефесянам и к Римлянам, на Нагорную проповедь, на Послания апостола и евангелиста Иоанна Богослова, а также сочинение «Иисус из Назарета», в котором разбирается проблема так называемого исторического Иисуса. Чарльз Гор признавал возможным историко-критическое исследование Священного Писания. По его мнению, в Библии могут встречаться исторические неточности, идеализация событий, не все книги принадлежат тем, чьими именами они надписаны (в том числе Пятикнижие).