Впоследствии его выводы были положены в основу методики критики текста Нового Завета и восстановления его истории, доминирующей в западной научной литературе до настоящего времени. В 1774 г. И.Я. Грисбах издал первый том своего критического издания греческого текста Нового Завета (синоптические Евангелия), в котором впервые вместо общепринятого текста предлагал собственную критическую реконструкцию ряда мест, которая сопровождалась большим критическим аппаратом. В основу реконструкции греческого текста Евангелий И.Я. Грисбах помимо найденных им рукописей положил и более ранние издания Дж. Милла и И.Я. Веттштейна. Несмотря на ряд исправлений, И.Я. Грисбах во многом следует общепринятому тексту, делая небольшие изменения там, где иной вариант чтения поддерживается многочисленными свидетельствами греческих рукописей и цитатами из раннехристианских авторов. Результатом дальнейших исследований стало второе издание греческого Нового Завета, сопровождённое И.Я. Грисбахом обширным критическим аппаратом и примечаниями. В предисловии к первому тому он рассматривает так называемые каноны оценки разночтений в новозаветном тексте (всего выделяет 15 канонов). Например, первый устанавливает, что более короткое чтение (если оно подкрепляется древнейшими и достоверными рукописями) нужно предпочесть более пространному, поскольку переписчики чаще дополняли текст, нежели сокращали его. Второй канон – вариант предложенного ещё И.А. Бенгелем принципа: «Более трудное или тёмное чтение нужно предпочесть тому, в котором всё ясно и гладко». Предисловие включает список использованных И.Я. Грисбахом рукописей и сокращений для их обозначения, во многом схожий с предложенной И.Я. Веттштейном. С именем И.Я. Грисбаха связан один из важнейших в истории библеистики опытов решения синоптической проблемы. Греческий текст первых трёх Евангелий он переиздал в 1776 г. под названием «Синопсис Евангелий от Матфея, от Марка и от Луки», расположив текст апостола Матфея в левой колонке, апостола Марка – в центральной, апостола Луки – в правой. Во втором издании «Синопсиса...» (1797 г.) к этим текстам И.Я. Грисбах добавил тексты Евангелия от апостола Иоанна о Страстях Христовых и о Воскресении Господнем. В третьем издании (1809 г.) помещены все другие параллельные синоптикам места из Евангелия от апостола Иоанна. Именно к этим изданиям восходят термины «синоптические» и «синоптики» для обозначения первых трёх Евангелий.