О ружном жалованье известно по данным второй половины XVII в. При царе Алексее Михайловиче братия получала «молебных, панихидных и милостинных денег» по 15 руб. в год. С 1701 г., после изъятия у Дмитровского монастыря права распоряжаться доходами с вотчин, на содержание каждого насельника выдавалось в год по 10 руб. и 10 четвертей хлеба, с 1706 г. – по 3 руб. 24 алтына и 4 деньги, а также по 5 четвертей хлеба в год. К 1764 г. (до учреждения штатов) насельники получали от 3 до 5 руб. в год, архимандрит – 5 руб., иеромонах – 4 руб., иеродиакон, монахи, бельцы (попы, дьяконы, пономарь и канонарх) – по 3 руб., а также натуральное жалованье хлебом и крупой. По штатам 1764 г. Дмитровский монастырь лишился вотчин и доходов. Обители были оставлены только огородная и садовая земля, сенокосы и рыбные ловли на реке Яхроме. К 1911 г. капитал Дмитровского монастыря исчислялся в 51 233 руб., к 1916 г. – в 54 704 руб. В 1914 г. из Польши в Дмитровский монастырь были эвакуированы насельницы небольшого Турковицкого женского монастыря, через некоторое время братию Дмитровского монастыря перевели в Мефодиев Пешношский во имя Николая Чудотворца монастырь. Среди насельниц Турковицкой обители в Дмитровском монастыре подвизалась Параскева (Матиешина), которая после 1921 г., когда турковицкие сёстры вернулись на родину, осталась в Дмитрове и была духовной дочерью епископа Дмитровского Серафима (Звездинского). В 1921 г. в помещениях Дмитровского монастыря поселились также игуменья София с сёстрами зарайской Бахрушинской женской общины Рязанской епархии. После 1917 г. Дмитровский монастырь был обращён в артель (вскоре ликвидирована). До начала 1930 гг. в Борисоглебском соборе, принадлежавшем зарегистрированной православной приходской общине, совершались богослужения. В годы архипастырского служения в Дмитровском викариатстве епископ Серафим (Звездинский) неоднократно служил и проповедовал в храмах монастыря. В 1926 г. Дмитровский монастырь был закрыт, по распоряжению Дмитровского исполкома в помещениях обители разместился городской краеведческий музей, в башнях устроены помещения для хранения музейных фондов. По воспоминанию Надежды Алексеевны Елизаровой-Соловьёвой, «музей не только успел отремонтировать и отреставрировать здания бывшего монастыря, но и сделать совершенно новую краеведческую экспозицию». С конца 1932 г. при строительстве канала Москва-Волга вся территория и помещения Дмитровского монастыря передавались управлению Дмитлага.