Обосновывая необходимость представления церковью этого документа, митрополит Кирилл подчеркнул, что права человека лежат в основе правовых систем стран, окормляемых РПЦ; многие верующие, живущие в диаспоре, также находятся в условиях доминирования этой концепции. Поэтому церковь призвана заявить о своём видении прав человека. Исходя из Священного Писания и Предания церкви нельзя утверждать, что права человека являются Божественным установлением. Митрополит Кирилл напомнил, что права человека имеют различные мировоззренческие источники: с одной стороны, они родились в культуре, которая в течение веков просвещалась христианством, с другой – они отразили и впитали в себя идеи, появившиеся в среде, отошедшей от евангельских истин в эпоху Возрождения и в Новое время. Отметив, что, несмотря на ослабление религиозности, в общественной морали западных стран до недавнего времени сохранялась приверженность христианской системе ценностей, митрополит Кирилл констатировал утрату нравственного согласия не только в обществе, но и во многих христианских общинах. После обсуждения доклада митрополита Кирилла с сообщением об изменениях и дополнениях, внесённых в «Положение о наградах Русской Православной Церкви», выступил митрополит Калужский и Боровский Климент, Управляющий делами Московской патриархии. Затем митрополит Климент представил членам Собора проект «Положения о церковном судопроизводстве». Поскольку нормы этого документа дополняют и конкретизируют отдельные положения Устава РПЦ, принятого Юбилейным Архиерейским Собором в 2000 г., было предложено внести соответствующие изменения в Устав. После обсуждения представленного проекта архиерейский Собор утвердил «Положение о церковном суде Русской Православной Церкви» и предложенные изменения в Уставе РПЦ. Собор избрал членов Общецерковного суда из числа архиереев сроком на четыре года. 27 июня, в четвёртый день работы архиерейского Собора, состоялось заключительное пленарное заседание. На нём был принят ряд итоговых документов Собора, в том числе «Определение о вопросах внутренней жизни и внешней деятельности Русской Православной Церкви», наметившее основные направления её дальнейшей деятельности, а также «Послание клиру, честному иночеству и всем верным чадам Русской Православной Церкви». Кроме того, на пленарном заседании было принято соборное решение о прещениях в отношении епископа Чукотского и Анадырского Диомида. Вопрос о деятельности епископа Диомида был рассмотрен на заседании рабочей группы «Православное свидетельство и современность». С докладом об итогах её работы выступил митрополит Воронежский и Борисоглебский Сергий. Деятельность епископа Диомида была признана наносящей вред РПЦ и ведущей к церковному расколу, его высказывания в адрес священноначалия – оскорбительными и клеветническими. После продолжительной дискуссии, в ходе которой своё мнение высказали патриарх Алексий II и около двадцати архиереев, большинством голосов Собор принял решение об извержении епископа Диомида из сана. В то же время, чтобы оставить для епископа Диомида возможность покаяться, Собор постановил отложить исполнение данного решения до очередного заседания Священного Синода РПЦ. На этом архиерейский Собор РПЦ завершил свою работу. В субботу 28 июня в Успенском соборе Московского Кремля был совершён благодарственный молебен, посвящённый завершению трудов Собора, а также празднованию 1020-летия Крещения Руси. В богослужении участвовали все члены архиерейского Собора. В тот же день в Государственном Кремлёвском дворце состоялся Торжественный акт, посвящённый 1020-летию Крещения Руси, на котором присутствовали участники Собора, представители поместных православных церквей и традиционных религий, политические и общественные деятели, священнослужители и миряне Русской церкви.