Право на получение религиозного образования было закреплено в законе РСФСР «О свободе вероисповеданий» (1990 г.), Федеральном законе РФ «О свободе совести и о религиозных объединениях» (1997 г.) и др. Но в законодательстве практически отсутствует правовое регулирование негосударственного сектора образования, в том числе религиозного. С начала 1990 гг. повсеместно стали учреждаться православные низшие и средние образовательные учреждения: гимназии, церковноприходские и воскресные школы, в которых Закон Божий стал основным предметом. При поступлении в высшие православные учебные заведения (в том числе семинарии), как правило, необходимо сдавать экзамен по Закону Божию. На всех факультетах Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета требуется сдавать основы христианства в объёме учебника протоиерея Серафима Слободского. В Российском православном университете святого апостола Иоанна Богослова проводится собеседование по Закону Божию. Однако в новых условиях предмет не может занять того места в системе образования, которое было у него до 1917 г. В современных православных гимназиях и других церковных учебных заведениях Русской православной церкви курс Закона Божия восстановлен и расширен (за счёт включения в программу полемического богословия, основ эортологии и т.п.). Закон Божий по своему содержанию остаётся вероучительной дисциплиной, ориентированной на воцерковление учеников, и не преподаётся в светских школах, в отличие от нового предмета «основы православной культуры» («духовно-нравственная культура»), который имеет культурологическую направленность и входит в учебную программу некоторых светских школ. Появилось много новых разработок по преподаванию Закона Божия. В 1990 г. вышла книга «Закон Божий: Начальные сведения для младшего возраста» с предисловием Льва Николаевича Гумилёва под названием «Возрождение истории». Ряд пособий составил Владимир Михайлович Зоберн, например, «Закон Божий для детей старшего возраста и новоначальных» (М., 2008 г.). Однако наиболее популярным и употребительным остаётся учебник протоиерея Серафима Слободского, выдержавший большое количество переизданий в России с конца 1980 гг. В состав курса Закона Божия в разных учебных заведениях входят основы православного вероучения, богослужения, Священная история, церковное пение, беседы о нравственных ценностях, основы апологетики. Система обучения в школах допускает большое разнообразие форм занятий, которые проходят в виде уроков, бесед, лекций. Проводятся дополнительные мероприятия: посещение храма, паломнические поездки. В рамках ежегодных Рождественских образовательных чтений организована постоянно действующая секция, где обсуждаются вопросы преподавания Закона Божия. С 1992 г. действует круглый стол по религиозному образованию и диаконии при Отделе внешних церковных сношений Московской патриархии, на котором, в частности, разрабатывается концепция преподавания Закона Божия, издаётся серия «Законоучитель» – сборник материалов в помощь преподавателю. В Екатеринбургской епархии с 1996 г. местный Отдел церковноприходских школ ежегодно созывал семинары для директоров, завучей и преподавателей с целью повышения их квалификации. С 2005 г. в епархии вместо семинаров ежегодно проводятся съезды законоучителей, в которых принимают участие священники и миряне, преподаватели Закона Божия, основ православной культуры. В программу съездов входят доклады, мастер-классы, обучающие семинары, круглые столы, презентации новых учебных пособий и трудов в области православного образования и просвещения.