Расцвет города Владимира продолжился при великом князе Всеволоде, брате Андрея Боголюбского. Князь, а также епископы Лука и Иоанн полностью обновили после пожаров 1185 и 1192 гг. храм Успения Пресвятой Богородицы (внешний облик здания с конца XII в. изменили пристройки и особенно реставрация конца XIX в.). Между Рождество-Богородицким монастырём и обновлённым, расширенным зданием Успенского собора, на видимом издалека крае Среднего города, Всеволод поставил княжеский двор: дворец (1194–1197 гг.; не сохранился), соединённый с придворной церковью, белокаменным храмом во имя Димитрия Солунского (1194–1197 гг.). Окружили валами со стенами детинец с дворами епископа и князя. От всего ансамбля княжеской резиденции сохранились только белокаменные, украшенные резьбой Дмитровский собор и кафедральный Успенский собор, который уже в XII в. стал местом погребения епископов и великих князей, впоследствии канонизированных. При князе Всеволоде резиденции князей Юрия и Андрея во Владимире стали иноческими обителями (см. Владимирский во имя Георгия Победоносца мужской монастырь, Владимирский Золотоворотский в честь Преображения Господня мужской монастырь). В северо-западной части Нового города Успенский собор владимирского Княгинина монастыря, усыпальница владимирских княгинь, претерпел со времени основания ряд перестроек и сохранился до настоящего времени уже в формах второй четверти XVI в. Процветание города Владимира, начавшееся с середины XII в., было надолго остановлено монголо-татарским нашествием. Не теряя статуса политического центра, он сохранял большое значение в церковном отношении даже после 1325 г., когда Московский митрополит Пётр перенёс свою резиденцию в Москву. С тех пор и до 1744 г. город не имел собственного епископа, находясь в непосредственном ведении сначала митрополитов, потом патриарха и затем Святейшего Синода. Владимир несколько раз разоряли почти полностью: в 1238 г. хан Батый, в 1382 г. был сожжён войском Тохтамыша, в 1411 г. – ратью татар царевича Талыча и воеводы нижегородского Даниила (был разграблен Успенский собор), в 1521 г. был захвачен казанскими и крымскими татарами под предводительством хана Махмет-Гирея, в 1614 г. разорён польско-литовскими набегами. В XIV–XV вв. Московские митрополиты и князья проявляли заботу о древних постройках. В 1362 г. митрополит Алексий возобновил Константино-Еленинский монастырь в восточном предместье Владимира. К владимирской святыне, чудотворной иконе Божьей Матери, обращались в конце XIV в. в связи с борьбой против татар (1380 г.), с нашествиями на Русь (1395 г.). В 1408 г. по воле великого князя Василия Димитриевича был расписан заново Успенский собор, в 1469 г. присланный из Москвы Василий Дмитриевич Ермолин руководил ремонтом Золотых ворот и церковью Воздвижения на Торгу; Успенский собор в последней четверти XV в. послужил образцом для строительства нового здания собора в Московском Кремле.