После перехода в ПЦУ в ведении бывшего митрополита Симеона находится кафедральный Преображенский собор в Виннице и около 20 приходов в окрестных сёлах. В браиловском во имя Святой Троицы женском монастыре находится чудотворная Браиловская Ченстоховская икона Божьей Матери (празднование 6 марта), в барском женском монастыре хранится чтимая Барская икона Божьей Матери (празднование 1 октября), в Иоанно-Предтеченском храме в селе Шевченко Литинского района находится чудотворная Зиновинская икона Божьей Матери. Святыней Винницкой епархии также является поклонный Крест на месте Калиновского чуда (в 1923 г. неподалёку от Калиновки красноармеец выстрелил в поклонный Крест, из которого при попадании истекла кровь; Крест в том же году был уничтожен, в 1993 г. восстановлен). Крестные ходы: 6 июля совершается крестный ход в честь Калиновского чуда (в юбилейные годы – от винницкого Воскресенского храма до Креста на месте Калиновского чуда), 28 сентября – крестный ход в честь Зиновинской иконы (по территории села Шевченко до Иоанно-Предтеченского храма), 19–26 августа крестный ход выходит из браиловского монастыря и движется в Почаевскую лавру к празднику Успения Пресвятой Богородицы. Действующие монастыри: браиловский во имя Святой Троицы (женский, основан в 1635 г., в 1723 г. перешёл в унию, в 1795 г. воссоединён с православием, в 1932 г. закрыт, действовал в 1942–1962 гг., в 1989 г. возрождён), апостола Иоанна Богослова (мужской, открыт в декабре 2001 г.), в честь Барской иконы Божьей Матери (женский, открыт 20 июля 2012 г.). Закрытые: бершадский в честь Преображения Господня (мужской, основан в 1616 г., восстановлен в конце XVIII в., закрыт после 1917 г.), Преображения Господня близ села Гранова (мужской, основан в XVII в., закрыт в 1930 гг.), барский в честь Покрова Пресвятой Богородицы (женский, основан в 1838 г. как мужской, с 1881 г. – женский, закрыт в 1962 г.), Александро-Мариинская женская пустынь близ села Рожка при браиловском Свято-Троицком монастыре (основана в 1795 г. на месте мужского монастыря, закрыта в 1923 г.).Архиереи: епископ священномученик Александр (Петровский; 7 сентября 1933 г. – 2 июня 1937 г.), архиепископ священномученик Иннокентий (Тихонов; 5 апреля – ноябрь 1937 г.), епископ Евлогий (Марковский; 5 августа 1942 г. – 1943 г.), епископ Максим (Бачинский; управлял епархией с 23 мая 1944 г.), епископ Варлаам (Борисевич; 13 мая 1945 г. – 3 января 1946 г.), в 1946 г. епархией управлял протоиерей Н. Салата; епископ Иаков (Заика; 2 февраля 1947 г. – 18 ноября 1948 г.), епископ Иннокентий (Зельницкий; 30 января 1949 г. – 27 декабря 1951 г.), епископ Андрей (Сухенко; с 27 декабря 1951 г. управлял епархией, 9 февраля 1954 г. – 17 октября 1955 г.), архиепископ Симон (Ивановский; октябрь 1955 г. – 14 августа 1961 г.), епископ Иоасаф (Лелюхин; 14 августа 1961 г. – 30 марта 1964 г., с 25 февраля 1964 г. – архиепископ), епископ Алипий (Хотовицкий; 30 марта 1964 г. – 11 ноября 1975 г., с 24 апреля 1966 г. – архиепископ), митрополит Агафангел (Саввин; 16 ноября 1975 г. – 7 августа 1991 г., апрель – 29 июня 1992 г., с 7 сентября 1981 г. – архиепископ, с 10 марта 1989 г. – митрополит), архиепископ Феодосий (Дикун; 1991–1992 гг.), архиепископ Макарий (Свистун; 22 июня 1992 г. – 4 июня 2007 г., с 2000 г. – митрополит), архиепископ Симеон (Шостацкий; 10 июня 2007 г. – 2018 г., с 2011 г – митрополит, в декабре 2018 г. запрещён в священнослужении), архиепископ Варсонофий (Столяр; с 17 декабря 2018 г., с 17 августа 2019 г. – митрополит).