Лев сразу же распорядился молиться об упокоении императора Петра II, но под предлогом неполучения указа из Синода (которого не было до 21 февраля) этим и ограничился. За архиерейской службой 15 февраля (в Неделю Торжества Православия) августейшее семейство поминалось по старшинству, начиная с царицы Евдокии Лопухиной, первой жены императора Петра I, возвращённой из ссылки императором Петром II. Губернская канцелярия 16 и 18 февраля того же года запрашивала епископа, когда будет объявлен манифест. Благодарственный молебен по случаю вступления новой императрицы на престол был отслужен только 20 февраля. В направленном в канцелярию уведомлении Лев обвинил Е.И. Пашкова в постоянном отсутствии на молебнах в царские дни. Опасаясь доноса вице-губернатора о позднем совершении им «молебного торжествования», епископ отправил свою «промеморию» в Синод с жалобой на оклеветание его Е.И. Пашковым. Донесение Льва Синод обсуждал 20 марта 1730 г. Архиепископ Георгий (Дашков) заявил, что у епископа с вице-губернатором давняя ссора, и предложил подождать, не будет ли какого извещения от гражданских властей. В течение трёх с половиной месяцев об этом случае не вспоминали. 8 июня вышел Высочайший указ о переводе Льва в Астрахань. Епископ был вызван в Москву, но не подал рапорт о получении указа и не спешил с отъездом. В это время архиепископ Феофан (Прокопович), демонстрируя преданность императрице, искал предлога, чтобы инициировать «архиерейские процессы» против тех, кого считал своими врагами. Медлительность Льва была расценена как неповиновение. Кроме того, архиепископу Феофану (Прокоповичу) стало известно, что Лев выражал неудовольствие указом императрицы Анны Иоанновны о переводе из Воронежа. 15 июля Синод наложил на епископа штраф и послал за ним нарочного. В тот же день архиепископ Феофан (Прокопович) от имени императрицы сделал запрос в канцелярию Синода «Отчего дело Льва по доносу воронежского губернатора до сего времени в Синоде не следовано и умолчано?». 21 июля Синод был «обновлён» так, что в его составе оказались только «покорные слуги» архиепископа Феофана (Прокоповича). 5 июля Лев выехал с ризницей в Москву и уже почти достиг Серпухова, когда его встретил нарочный. На переправе через реку Оку епископ по Высочайшему повелению был задержан и отвезён в Угрешский во имя святителя Николая Чудотворца монастырь. Затем Лев был доставлен в Москву, где 23 июля получил допросные пункты от Синода. Епископа обвинили в злонамеренности действий и потребовали признаться, «ради какой себе пользы» он медлил с отправлением молебна и с кем в сговоре действовал.