Исследователям известны случаи мятежей ливанских горцев против владетелей Джубайля и Триполи (в Лехфеде в 1230 гг., в селении Хадат (ныне Хадат-эль-Джубба) в верховьях долины Кадиша в 1282 г.). Нередко это сопровождалось отпадением местных иерархов от унии с католической церковью. Наиболее известен исследователям раскол 1282 г., когда патриарх Лука аль-Бнахрани и ряд монашеских лидеров вернулись к традиционному исповеданию и увлекли за собой население Бшарри. Правители мусульманской Сирии (атабеки Дамаска, а после них Зенгиды) переселяли в горы Южного Ливана новые арабские племенные группы в качестве заслона от крестоносной угрозы. Вскоре после падения Бейрута в горном районе Эль-Гарб, охватывающем Бейрут полукольцом с юга, утвердился клан Бухтуридов; южнее, в районе Эш-Шуф, – род Маан (1120 г.); в районе Вади-эт-Тайм – род Шихаб (1174 г.). Правители Дамаска предоставили главам племенных групп переселенцев титулы эмиров, они получили право сбора налогов с подвластных территорий и должны были защищать эти земли от крестоносцев. Ключевую роль в ливанской политике XII–XIV вв. играли Бухтуриды благодаря непосредственной близости к Бейруту. Правящие кланы восприняли друзскую религию местного населения, но, следуя шиитской практике сокрытия своих убеждений (такийя), не демонстрировали свою религиозную принадлежность перед суннитскими сюзеренами. Пограничное положение друзских эмиров и отсутствие у них больших военных ресурсов вынудили Бухтуридов вести сложную политическую игру, балансируя между крестоносцами, Айюбидами Каира и Дамаска, позже – монголами и мамлюками. В 1170 г. главы клана Бухтуридов были вероломно убиты во время визита в Бейрут, район Эль-Гарб опустошили крестоносцы. После разгрома армии крестоносцев в битве при Хаттине (июль 1187 г.) айюбидский султан Салах-ад-Дин появился на побережье и быстро овладел Бейрутом и Сайдой. Однако Сур, где собрались гарнизоны крестоносцев, отступившие из оставленных крепостей, оказал упорное сопротивление и отразил осаду мусульман. Прибытие на Восток воинов третьего Крестового похода и последующих крестоносных контингентов изменило баланс сил на побережье. В 1197 г. крестоносцы вернули Бейрут. Долина Бекаа оставалась во владении мусульман: в частности, в первой половине XIII в. Баальбек был уделом одной из ветвей клана Айюбидов. Графство Триполи играло заметную роль в политике крестоносных государств. В XIII в. триполийские графы претендовали на трон Антиохийского княжества и периодически распространяли на него свою власть. Угасание правящей династии в конце 1280 гг. привело к усилению в Триполи генуэзского влияния. Мамлюки наносили удар за ударом по крепостям графства. В 1266 и 1268 гг. армии султана Бейбарса опустошили район Бшарри. В 1283 г. войско туркмен, посланное султаном Калауном, сожгло Ихдин, Хадат и другие селения в верховьях долины Кадиша. Многие жители были убиты, а маронитский патриарх Лука аль-Бнахрани, пытавшийся организовать сопротивление, попал в плен. В 1289 г. султан Калаун лично возглавил поход на Триполи, и в апреле город был взят и разграблен мамлюками. После падения столицы Иерусалимского королевства Акры (Акки) в мае 1291 г. оставшиеся крепости крестоносцев, в том числе Сур, Бейрут, Джубайль, сдались мамлюкам без сопротивления.