Авторитет императора оставался высоким и после Лионского собора, однако Фридриху II Штауфену не удалось реализовать план похода в Германию и во Францию. Сокрушительное поражение под Пармой (12 февраля 1248 г.) ознаменовало начало быстрого упадка империи Штауфенов. После смерти Фридриха II (1250 г.) в борьбе наметился перелом. В Германии нарастала смута, а Сицилийское королевство, переданное папой Карлу I Анжуйскому, после смерти короля Манфреда (1266 г.) и казни его племянника Конрадина (1268 г.) окончательно стало владением Анжуйской династии. В Восточной Европе Папский престол пытался претворить в жизнь декрет «Christianae religionis». Иннокентий IV ежегодно обращался с призывом к Крестовому походу против татар. Уже после ухода татар венгерский король Бела IV (1235–1270 гг.) начал выдавать магнатам разрешения на строительство крепостей в их владениях, что раньше было категорически запрещено. Однако главные усилия Иннокентия IV были направлены не на организацию военного отпора, а на создание союзов как католических, так и православных государств для совместной обороны. Это направление политики католической церкви включало также миссионерский аспект и было тесно связано с вопросом о заключении унии с русскими князьями. Так, рассчитывая на помощь Запада, Галицко-Волынский князь Даниил Романович (1205–1264 гг., с перерывами) согласился с предложением главы папского посольства францисканца Джованни дель Плано Карпини заключить унию с Римско-католической церковью (после переговоров, проведённых в 1246–1247 гг.), добившись также договорённости об оборонительном союзе. Даниил Галицкий обязался сообщать в Римскую курию о действиях татар, а папа Иннокентий IV обещал ему помощь крестоносцев и католических государей Европы. После 1246 г. в Восточной Европе оформились военные союзы Венгрии, Тевтонского (Немецкого) ордена, Польши и Галицкой Руси. Однако они (за исключением союза князя Даниила и короля Белы IV) оказались непрочными из-за различий интересов сторон и неспособности организовать совместную борьбу с татарами. Церковная уния также оказалась недолговечной. Не получив реальной поддержки от папы, Даниил Галицкий в 1248 г. прервал с ним отношения. В 1252 г. (или в 1248 г.) при посредничестве Белы IV переговоры были возобновлены, а в 1253 г. папский легат Опицо из Медзано совершил коронацию Даниила Романовича. Тем не менее, в 1257 г. произошёл окончательный разрыв; в послании 1257 г. папа Римский Александр IV (1254–1261 гг.) упрекал Даниила Романовича за отступничество. Таким образом, постановление Лионского собора о борьбе с татарами практически не было выполнено.