Докторантура Теологикума имеет договорные отношения на проведение совместных исследований с некоторыми высшими учебными заведениями, в том числе с докторантурой «Древний и средневековый мир» при Сорбонне (университет Париж-IV), с факультетами богословских и религиозных знаний Университета Лаваля в Квебеке (Канада) и Монреальского университета (Канада), с теологическими факультетами Лёвенского католического университета (Бельгия), университетов Тулузы и Яунде (Камерун), с Православным богословским институтом преподобного Сергия Радонежского в Париже. В Теологикуме выпускаются научные журналы, в том числе ежеквартально – «Recherches de science religieuse» («Религиоведческие исследования»), «Revue des sciences philosophiques et theologiques» («Журнал богословских и философских исследований»), «La Maison-Dieu» («Дом Божий»), и серии книг; периодическая серия «Theologia» («Теология») и др. В 1895 г. в связи с ликвидацией факультета канонического права Сорбонны (Faculté de decret; лат. Consultissima decretorum) по распоряжению папы Льва XIII на базе юридического факультета Парижского католического университета был создан факультет канонического права. В знак преемства он сохранил латинское название «Consultissima iuris canonici». Дипломы факультета канонического права признаются Папским престолом и Французским государством. Первый этап обучения рассчитан на один год. Диплом государственного образца, который выдаётся после окончания второго этапа обучения, рассчитанного на три года, позволяет поступить в докторантуру Католического института по специальности «каноническое право». Факультет участвует в издании ежегодника «L'année canonique» («Канонический год»). Философский факультет был создан в 1895 г. по распоряжению папы Льва XIII. Выдаёт признаваемые Папским престолом и Французским государством дипломы о присвоении степени бакалавра (после первого цикла обучения, три года) и лиценциата (после второго цикла обучения, два года) философии. С дипломом лиценциата можно поступить в имеющуюся при факультете докторантуру. Философский факультет Католического института выпускает периодические серии книг: «Philosophie et Theologie» («Философия и теология»), «Chaire de Étienne Gilson» («Кафедра Этьена Жильсона»). Факультет социальных и экономических наук был создан в 1980 г. на базе Института социальных исследований, открытого в Католическом институте в 1923 г. В 1982 г. факультет получил каноническое утверждение Папского престола. Выдаёт признаваемые Папским престолом и Французским государством дипломы бакалавров социальных, экономических и политических наук (после первого цикла обучения, три года). После второго цикла (один год) студенты получают возможность поступить в имеющуюся при факультете докторантуру по соответствующей специальности. Филологический факультет, старейший в Католическом институте, существует с 1875 г. Обучение предполагает специализацию по французской, английской, немецкой или испанской филологии, а также по истории искусств. При успешном окончании первого (три года) и второго (два года) циклов обучения выдаётся диплом государственного образца. Педагогический факультет был открыт в 1993 г. на базе Высшего института педагогики, созданного в Католическом институте в 1963 г. Факультет выдаёт дипломы государственного образца после первого и второго циклов обучения, а также предоставляет возможность обучаться в докторантуре. Официальный журнал – «Éduquer/Former» («Обучать и подготавливать»).