5 мая 2009 г., во время празднования 120-летия основания факультета, он получил новое официальное название – Теологикум (Theologicum). Обучение состоит из трёх уровней (циклов). Первый цикл – «Начальная и фундаментальная теологическая формация» (пять лет) – рассчитан на обучение семинаристов, членов монашеских Орденов и конгрегаций, а также мирян, которым предоставляется возможность посещать занятия в вечернее время или по субботам. После окончания присваивается степень бакалавра теологии. Второй цикл – «Библейская и систематическая теология» (два года) – включает изучение Священного Писания, догматического и морального богословия, патристики, средневекового богословия, истории церкви и других дисциплин. После окончания присваивается степень лиценциата теологии. Третий цикл представляет собой обучение в докторантуре при Теологикуме. Обучение, приравненное ко второму циклу, можно получить также в связанных с факультетом Высших институтах и в Школе языков и цивилизаций Древнего Востока. В 1950 г. по инициативе французского епископата был основан Высший институт пасторской катехизации (Institut supérieur de pastorale catéchétique) для подготовки диоцезиальных катехизаторов. В связи с развитием в католической церкви литургического движения в 1956 г. при теологическом факультете Католического института совместно с Парижским центром пасторской литургики и лёвенским аббатством Мон-Сезар (Кейзерсберг) был основан Высший институт литургики (Institut supérieur de Liturgie), целью которого стала подготовка специалистов по литургическому богословию и сакраментологии. В 1967 г. декан теологического факультета Жан Даниелу основал Высший институт религиоведения и теологии религий (Institut supérieur de Science et de Théologie des Religions), сотрудники которого исследуют разные аспекты мировых религий для проведения межрелигозного диалога, санкционированного вторым Ватиканским собором. В том же году был открыт Высший институт экуменических исследований (Institut supérieur des études œcuméniques), в задачу которого входит развитие межхристианского диалога. В работе этого института принимают участие сотрудники Парижского института протестантской теологии и Православного богословского института преподобного Сергия Радонежского в Париже. В 1995 г. при теологическом факультете появился Высший институт богословия искусства (Institut supérieur de théologie des arts), занимающийся вопросами соотношения христианской веры и искусства. Школа языков и цивилизаций Древнего Востока (École des langues et civilisations de l'Orient Ancien) была создана на теологическом факультете в 1992 г. вместо существовавшей с 1914 г. Школы древних восточных языков. Школа имеет право присваивать степени бакалавра и лиценциата по специальности «философия и история Древнего Востока». В настоящее время в школе ведётся углублённое изучение древних и восточных языков и культур по секциям «Библейский мир» (еврейский, греческий, латинский и арамейский языки), «Христианский Восток» (арабский, армянский, коптский и сирийский языки, а также греческий язык времени патристики) и «Древний Ближний Восток» (угаритский, аккадский и древнеегипетский языки и культуры). В 2012 г. введено изучение древнеславянского языка. Среди получивших докторскую степень в Теологикуме – многие католические иерархи, богословы и историки, в том числе кардинал Альфред Бодрийар, кардинал Жан Мари Вийо, кардинал Жан Даниелу, Венский архиепископ кардинал Кристоф фон Шёнборн, член Французской академии Клод Дажен, епископ Ангулема, и др.