К тексту новой книги, существенно дополненному по сравнению с текстом первой монографии, Г.Я. Киприанович в качестве приложения добавил составленную митрополитом Иосифом (Семашко) при помощи его секретаря псаломщика М. Григи часть мемуаров архиерея за 1861–1868 гг., которая по не известной исследователям причине не вошла в изданные Академией наук трёхтомные «Записки Иосифа, митрополита Литовского». За это исследование Синод удостоил Г.Я. Киприановича Макариевской премии в 1000 руб. Впоследствии Г.Я. Киприанович опубликовал брошюру «Письма архиепископа Иосифа Семашко к епископу Брестскому Михаилу Голубовичу» (1898 г.), подготовил к печати дополнительные материалы по теме «Неизданные записки Иосифа, митрополита Литовского, извлечённые из протоколов Литовского епархиального архиерея» и собрание документов из личного архива архиерея под названием «Неизданные распоряжения Иосифа, митрополита Литовского» (но эти материалы не были изданы). В описании Г.Я. Киприановича митрополит Иосиф, посвятивший всю жизнь упразднению унии и преодолению её последствий, предстаёт борцом за православие в крае, где долгие столетия господствовали католицизм и полонизм. Автор подробно исследует все обстоятельства жизни и деятельности Иосифа, раскрывает особенности его становления как церковного деятеля и архипастыря, выявляет глубинную мотивацию его поступков. Книга Г.Я. Киприановича «Жизнь Иосифа Семашки…» остаётся самым обширным и обстоятельным исследованием, посвящённым деятельности митрополита Иосифа. В сферу научных интересов Г.Я. Киприановича входил также широкий круг проблем конфессиональной истории Белоруссии и Литвы. В «Вестнике Виленского Православного Свято-Духова братства» (Г.Я. Киприанович был членом редакции), в журналах «Виленский вестник», «Церковный вестник», «Заря», «Православное обозрение», «Литовские епархиальные ведомости» и др. печатались его статьи, посвящённые вопросам истории не только православия, но и унии и католицизма. Его многолетний труд завершился публикацией монографии «Исторический очерк православия, католичества и унии в Белоруссии и Литве с древнейшего до настоящего времени». Первое издание книги вышло в городе Вильна в 1895 г., второе – там же в 1899 г. Это исследование Г.Я. Киприанович подал на конкурс на соискание Уваровской премии, которую получил в 1899 г. По мнению исследователей, «Исторический очерк…» Г.Я. Киприановича остаётся единственным в своём роде целостным описанием конфессиональной истории Белоруссии до конца ХIХ в. Кроме этих сочинений Г.Я. Киприановичу принадлежат исследования «К истории женского образования в Западной России: (Историческая записка ко дню 50-летия Виленской, Гродненской и Ковенской гимназий), 1860–1910» (1910 г.), «Архиепископ Полоцкий и Витебский Иосафат Кунцевич, западнорусский мученик за унию с Римом (по новым научным данным)» (1912 г.). Характерной чертой исследований Г.Я. Киприановича исследователи считают работу с источниками по изучаемым проблемам, глубину выводов, популярный характер изложения и доступность содержания.