Частица мощей хранилась в иконе Германа в Иоанно-Предтеченском соборе, а после 1929 г. – под престолом храма во имя св. князей Фёдора, Давида и Константина, чудотворцев Ярославских, на Арском кладбище Казани (с 2011 г. частица мощей вновь пребывает в Казанском монастыре в специальной раке). Чтимыми были иконы св. Иоанна Предтечи, Божьей Матери «Неупиваемая Чаша», «Всех скорбящих Радость», Страстная и Тихвинская. Все иконы, кроме Страстной, сохранились и к 2012 г. находились в монастыре. В библиотеке обители хранились Евангелия 1753, 1764, 1783 гг. С 22 сентября 1918 г., после конфискации архиерейского дома и здания консистории в Казанском кремле, в зданиях монастыря расположилось Казанское епархиальное управление. Здесь проживали Казанский митрополит Кирилл (Смирнов; в 1920 и 1922 гг.), временно управляющие Казанской епархией викарные епископы Анатолий (Грисюк), Иоасаф (Удалов), Афанасий (Малинин). В 1921–1923 гг. большинство братии составляли выпускники и недоучившиеся (из-за закрытия академии) студенты Казанской духовной академии, в том числе и архиереи, репрессированные впоследствии: митрополит Палладий (Шерстенников), архиепископ Питирим (Крылов), епископы Феофан (Еланский), Иоанн (Широков), Серафим (Шамшев). В июне 1923 г. все, кроме архимандрита Палладия, были арестованы, а 14 декабря приговорены к трём годам лишения свободы и отправлены на Соловки. В 1921–1926 гг. настоятелем Казанского монастыря был епископ Андроник (Богословский). По воспоминаниям местных жителей, большую часть времени он пребывал в Седмиезерской Богородицкой пустыни. В 1926 г. в постройках Казанского монастыря разместилось Казанское обновленческое епархиальное управление. В 1929 г. Казанский монастырь был окончательно закрыт, в 1931 г. снесён Иоанновский собор, разобрана ограда. Домовая Введенская церковь принадлежала обновленческой общине до 1936 г. Позже в братских корпусах были устроены коммунальные квартиры. Настоятельский корпус занимали советские учреждения, а в 1980 гг. – республиканское отделение Общества охраны памятников истории и культуры. В 1992 г. Казанской епархии были переданы братские корпуса и колокольня, в 1998 г. возвращён настоятельский корпус. Решением Синода РПЦ от 16 июля 1995 г. Казанский монастырь был возобновлён. Настоятелем стал архиепископ Казанский и Татарстанский Анастасий (Меткин), наместником – игумен Нектарий (Дёмин); в составе братии восемь монашествующих. Восстановлены ограда, корпуса, бывшая домовая Введенская церковь переосвящена во имя св. Иоанна Предтечи. В храме в особой гробнице хранится частица мощей святителя Германа. Благодаря расположению в центре города, рядом с кремлём и Никольским кафедральным собором, монастырский храм является одним из самых посещаемых в городе.