К маю 2011 г. в коллективе Исторического музея насчитывалось 274 научных сотрудника, в том числе 81 кандидат и шесть докторов наук. Исторический музей является крупнейшим хранилищем источников по истории Русской церкви и памятников церковной старины. Рассматривая церковную сферу как неотъемлемую часть народной жизни, основатели музея заботились о приобретении предметов, характеризующих все периоды развития русской религиозности. В числе таковых приобретений, пополнявших отдел церковных древностей и домашних святынь, согласно ежегодно публиковавшимся отчётам о покупках, – кресты, мощевики, панагии, образки, литургические предметы, лампады, иконы, хоругви, паникадила, предметы церковной обстановки, облачения, рукописи, вериги и многие другое. Среди этих предметов были, в частности, серебряная дароносица, принадлежавшая боярину Ивану Васильевичу Бутурлину (XVII в.), редкая икона «Преподобный Иаков Боровичский на фоне Иверского монастыря» (первая половина XVII в.), богато иллюстрированное Житие св. Нифонта Констанцкого (1530–1540 гг.), ставротека с изображением Спасителя на престоле (конец XV – начало XVI вв.), «Псалтирь Томича» (около 1360 г.), панагия из рога носорога, привезённая со Святой земли и заключённая в фигурную оправу русской работы (первая треть XIX в.). Приобретались и предметы, отражающие события церковной истории рубежа XIX и XX вв. Так, в 1912 г. в Успенском соборе был приобретён эмалевый образок «Св. Гермоген, Патриарх Московский», изготовленный к канонизации святителя (подробная характеристика коллекции церковных древностей была опубликована в Отчете Императорского Российского Исторического музея за XXV лет. 1916 г.). Значительное число уникальных памятников попало в музей как в качестве даров отдельных лиц, так и в составе частных коллекций, поступивших в музей: Сергея Ивановича Щукина: иконы, пелены, рукописи, предметы мелкой пластики, церковная утварь, архивы церковных деятелей, в том числе Дмитровского епископа Леонида (Краснопевкова) и Угличского епископа Амфилохия (Сергиевского-Казанцева), А.С. Уварова (христианская археология, иконы, документы, рукописи), Е.В. Барсова (материалы по истории северных церквей и монастырей), И.А. Вахрамеева (рукописи, в том числе знаменитое лицевое Житие преподобных Зосимы и Савватия Соловецких конца XVI – начала XVII вв.), Алексея Викуловича Морозова (иконы), Степана Павловича Рябушинского (иконы). В Историческом музее хранятся ценные документы по истории Русской церкви (Деяние Константинопольского Собора 1593 г., Деяния Московских Соборов 1654, 1657, 1666–1667 гг., подготовительные материалы к Собору 1666–1667 гг., грамоты жалованные, благословенные, настольные, ставленные, вкладные, грамоты Константинопольских патриархов, материалы о связях с Константинопольским патриархатом и Западнорусской митрополией); сочинения и автографы церковных иерархов и глав Русской церкви. Широко представлены памятники церковной письменности (Жития, сказания, гимнография, певческие книги), в том числе такие раритеты, как Изборник Святослава 1073 г., Мстиславово Евангелие XII в., новгородские служебные Минеи XII в., Юрьевское Евангелие (1119–1128 гг.), Галичское Евангелие (1144 г.), Псковский Апостол с цитатой из «Слова о полку Игореве» (1307 г.), Геннадиевская библия (1499 г.), Великие Минеи-Четьи митрополита Макария (середина XVI в.), Чудовские (1600 г.) и Милютинские Минеи-Четьи (1646–1654 гг.).