В разгар споров греческий Мелитинский митрополит ударил Иоанна VIII (VII) по щеке, а тот в ответ подставил другую, что вызвало одобрение присутствовавших вельмож. Возмущённые поведением греческих епископов, они не пришли на второе заседание Собора, на котором, таким образом, присутствовали только клирики. Спор зашёл об обрядовой стороне яковитского богослужения (употребление елея при приготовлении евхаристического хлеба, совершение крестного знамения одним перстом). На заключительной аудиенции у императора Иоанн VIII (VII) не присутствовал. После отказа присоединиться к православной церкви яковиты содержались в заточении в тюрьме Нумеры (август-октябрь 1029 г.). Эта мера возымела действие: трое из сопровождавших Иоанна VIII (VII) епископов (епископ Мелитины Игнатий, епископ Хесна-де-Зияд Моисей и епископ Арки Исаак) согласились принять халкидонскую веру, отчасти обманутые православным митрополитом Мелитины, который представил им этот факт как простое выражение почтения к императору. Однако Иоанн VIII (VII) остался непреклонен и 13 октября 1029 г. был сослан в монастырь Ганос во Фракии, где скончался. Принявшие соглашение епископы были вынуждены вторично отвергнуть яковитское вероисповедание, анафематствовать учителей монофизитства Диоскора Александрийского и Севира Антиохийского и признать недействительными все совершённые над ними таинства. Патриарх Алексий Студит перекрестил их на Пасху 1030 г. Игнатий Мелитинский скончался в Константинополе, два других вернулись в Сирию, где раскаялись в отступничестве. По версии Жития Иоанна VIII (VII), епископ Симанду Илия, не принявший халкидонитство, был до смерти побит камнями у ворот императорского дворца; епископ Хадета Иоанн (Иваннис) скончался в заточении; лишь епископ Телль-Патрика Дионисий был освобождён после смерти императора Романа (1034 г.) и благополучно вернулся на кафедру. В связи с этими событиями преемник Иоанна VIII (VII) Дионисий IV перенёс патриаршую резиденцию в район Амиды (ныне Диярбакыр, Турция), который находился под управлением мусульман. Племянник Иоанна VIII (VII) Феодор бар Абдун также стал впоследствии патриархом с именем Иоанн IX (VIII; 1042–1057 гг.). Память Иоанна VIII (VII) встречается под 1 февраля в Мартирологе Раббана Слибы (XIV в.) и в Минологиях 1547 и 1656 гг. из Халеба (Алеппо). Сохранилась переписка Иоанна VIII (VII) с коптским Александрийским патриархом Захарией (по два письма от каждой стороны).